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Población Trigos Primaverales UCDavis

Ivan Muñoz — Tue, 03 Sep 2024 01:32:41 +0000

MAPEO GENÉTICO

Población Trigos Primaverales UC Davis

Esta población de mapeo por asociación fue desarrollada por el laboratorio del Dr. Jorge Dubcovsky (UC Davis EE. UU.). Los resultados mostrados en esta página son los obtenidos y publicados por Franco et al (2022).

Información de la colección:

Una colección de 245 líneas primaverales de trigo pan de varios programas de mejoramiento fue utilizado para el análisis GWAS. Este panel incluyó variedades insensibles al fotoperiodo, lo cual proporciona una muy buena adaptación de todos los genotipos a las condiciones de cultivo en Argentina. Esta colección incluyó 69 genotipos del CIMMYT, 42 de la Universidad de California en Davis (UCD), 26 de la Universidad de Idaho (UIA), 19 de la Universidad de Minnesota (UMN), 15 de la Universidad Estatal de Washington (WAS), 12 de la Universidad Estatal de Dakota del Sur (SDSU) y 62 accesiones de otros programas de mejoramiento de EE. UU. y otros 14 países (Zhang et al., 2018).

Tipo de Población: Mapeo por Asociación

Tamaño de la Población: 245 genotipos

Origen: UC Davis, EE. UU. Responsable de la población: Jorge Dubcovsky

Plataforma de genotipado: Infinium wheat SNP 90K iSelect assay (Illumina Inc., San Diego, CA, EE. UU.) desarrollado por el International Wheat SNP Consortium (Wang et al., 2014).

Estructura de la población

La estructura genética de la población fue investigada utilizando el software STRUCTURE 2.3.4 (Pritchard et al., 2000) y análisis de componentes principales (PCA) con el paquete ade4 en R (Dray y Dufour, 2007). Como resultado, cuatro subpoblaciones fueron determinadas como las más representativas de la estructura de la población (Fig. 1).

Figura 1: Análisis de la estructura en el panel de mapeo por asociación de trigo pan. a) El análisis de estructura mostró cuatro sublpoblaciones hipotéticas representadas por diferentes colores. b) Los dos primeros componentes (PC1 y PC2) de un análisis de componentes principales de las entradas de trigos primaverales codificados por colores según el programa de mejoramiento (adaptado de Zhang et al., 2018). c) Árbol filogenético Neighbor joining mostrando las subpoblaciones correspondientes al análisis de estructura.

Caracteres fenotipificados en la población:

Resistencia de plántula frente a roya amarilla:

IT: Tipo de infección (evaluada frente a dos razas: Yr19-71 y Yr20-161)

Resistencia de planta adulta:

DS: Severidad de la enfermedad

AUDPC: Área bajo la curva de progreso de la enfermedad

Análisis de asociación
Los análisis GWAS se realizaron utilizando 22.226 SNP informativos en el conjunto de los 245 genotipos. Los análisis se llevaron a cabo mediante el software R (2020) con el paquete GAPIT 3 (Genomic Association and Prediction Integrated Tool v3) (Wang y Zhang, 2021). El método utilizado fue BLINK (Bayesian- information and linkage-disequilibrium iteratively nested keyway) (Huang et al., 2019).
Para reducir asociaciones espurias se utilizó la estructura de la población como covariable en el modelo. Para minimizar la probabilidad de asociaciones falsas positivas entre marcadores y rasgos, los loci de asociación significativos se consideraron a un valor ajustado de P < 0.01 en el genoma, basado en el método de corrección múltiple False Discovery Rate (FDR) (Storey y Tibshirani, 2003). En la Figura 2 y Tabla 1 se presentan aquellos marcadores SNP significativamente asociados que satisficieron estos criterios.

Resultados del análisis GWAS de la población

Figura 2: Gráficos circulares de Manhattan para la resistencia a la roya estriada en la colección de 245 genotipos de trigo pan evaluados para a) Resistencia en plántulas (dentro: tipo de infección -IT- para la raza Yr19-71; fuera: IT para Yr20-161) y b) Resistencia de planta adulta (dentro: severidad de la enfermedad –DS-; fuera: área bajo la curva de progreso de la enfermedad -AUDPC. Los SNP asociados están representados con estrellas rojas.

Tabla 1. SNP asociados significativamente con la Resistencia de plántula a la roya estriada en la colección de trigo pan.

Carácter	Cromosoma	SNP	Posición Física	Alelo *	Valor P	FDR ajustado	R^2
IT (Yr19-71)	1B	Tdurum_contig11004_688	62487859	C/T	5,02E^-15	1,27×10^-10	32,62
IT (Yr20-161)	1B	Tdurum_contig44861_581	28019260	C/A	1,59E^-07	1,01 x10^-03	16,48
	2A	BobWhite_c4517_120	755790846	A/G	7,64E^-07	3,23 x10^-03	6,59
	3A	Excalibur_rep_c103091_266	79761951	C/T	2,14E^-08	3,29 x10^-04	8,34
	5B	wsnp_Ex_c33932_42333941	12898000	A/G	6.79E^-07	3,23 x10^-03	1,99

* El alelo favorable se muestra subrayado.

Tabla 2. SNP asociados significativamente con la Resistencia de plántula a la roya estriada en la colección de trigo pan.

Carácter	Cromosoma	SNP	Posición Física	Alelo *	Valor P	FDR ajustado	R^2
DS	3B	wsnp_Ku_c33335_42844594	71871162	A/G	2,26E^-07	2,86×10^-03	13,40
DS	7A	wsnp_Ex_c20062_29096408	96809079	T/C	8,10E^-08	2,052×10^-03	7,67
AUDPC	3B	CAP12_rep_c7064_56	43970547	T/C	1,47E^-08	1,864×10^-04	8,15
	3B	wsnp_Ku_c33335_42844594	71871162	A/G	4,06E^-08	3,428×10^-04	14,01
	7A	wsnp_Ex_c20062_29096408	96809079	T/C	5,81E^-10	1,472×10^-05	7,79

* El alelo favorable se muestra subrayado.

Referencias

Dray, S., & Dufour, A. (2007). The ade4 Package: Implementing the duality diagram for ecologists. Journal of Statistical Software, 22(4), 1-0. https://doi.org/10.18637/jss.v022.i04
Franco, M. F., Polacco, A. N., Campos, P. E., Pontaroli, A. C., & Vanzetti, L. S. (2022). Genome-wide association study for resistance in bread wheat (Triticum aestivum L.) to stripe rust (Puccinia striiformis F. Sp. tritici) races in Argentina. BMC Plant Biology, 22(1), 543. https://doi.org/10.1186/s12870-022-03916-y
Huang, M., Liu, X., Zhou, Y., Summers, R. M., & Zhang, Z. (2018). BLINK: A package for the next level of genome-wide association studies with both individuals and markers in the millions. GigaScience, 8(2). https://doi.org/10.1093/gigascience/giy154
Pritchard, J. K., Stephens, M., & Donnelly, P. (2000). Inference of population structure using Multilocus genotype data. Genetics, 155(2), 945-959. https://doi.org/10.1093/genetics/155.2.945
Storey, J. D., & Tibshirani, R. (2003). Statistical significance for genomewide studies. Proceedings of the National Academy of Sciences, 100(16), 9440-9445. https://doi.org/10.1073/pnas.1530509100
Wang, J., & Zhang, Z. (2021). GAPIT version 3: Boosting power and accuracy for Genomic association and prediction. Genomics, Proteomics & Bioinformatics, 19(4), 629-640. https://doi.org/10.1016/j.gpb.2021.08.005
Wang, S., Wong, D., Forrest, K., Allen, A., Chao, S., Huang, B. E., Maccaferri, M., Salvi, S., Milner, S. G., Cattivelli, L., Mastrangelo, A. M., Whan, A., Stephen, S., Barker, G., Wieseke, R., Plieske, J., Lillemo, M., Mather, D., & Akhunov, E. (2014). Characterization of polyploid wheat genomic diversity using a high‐density 90 000 single nucleotide polymorphism array. Plant Biotechnology Journal, 12(6), 787-796. https://doi.org/10.1111/pbi.12183
Zhang, J., Gizaw, S. A., Bossolini, E., Hegarty, J., Howell, T., Carter, A. H., Akhunov, E., & Dubcovsky, J. (2018). Identification and validation of QTL for grain yield and plant water status under contrasting water treatments in fall-sown spring wheats. Theoretical and Applied Genetics, 131(8), 1741–1759. https://doi.org/10.1007/s00122-018-3111-9

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MA 102 Variedades Argentinas

Ivan Muñoz — Thu, 16 Sep 2021 21:15:17 +0000

MAPEO GENÉTICO

MA 102 VARIEDADES ARGENTINAS

Esta pequeña población de mapeo por asociación se desarrolló originalmente para el estudio de caracteres asociados a la adaptación del cultivo y a componentes de rendimiento, los resultados mostrados en esta página son los obtenidos y publicados por Basile et al. (2019).

Información de la colección:

Un conjunto de 102 variedades de trigo pan descritos anteriormente (Vanzetti et al., 2013) que incluye variedades antiguas (como el cv. Barletta 77, en 1927) y cultivares comerciales recientes (hasta 2010) fueron seleccionados entre las principales empresas de mejoramiento de trigo en Argentina y utilizado para la construcción de bloques de haplotipos y análisis GWAS. Las semillas fueron obtenidas del Banco de Germoplasma de trigo de la Estación Experimental INTA Marcos Juárez.

Tipo de Población: Mapeo por Asociación.

Tamaño de la Población: 102 genotipos

Origen: EEA INTA Marcos Juarez. Responsable del proyecto Dr. Leonardo Vanzetti

Plataforma de genotipado: Axiom® 35K SNP Wheat Breeder’s Array (Affimetrix)

Esquema del cromosoma 1B donde se observa el alto DL provocado por la presencia de la translocación de centeno 1BL/1RS en alta frecuencia en el germoplasma argentino de trigo pan utilizado.

Estructura de la población (Matriz Q)

la estructura genética en el nivel de población utilizando el software R STRUCTURE (François, 2016)

Figura 1: Análisis de la estructura de la colección de 102 cultivares de trigo hexaploides argentinos. El análisis de estructura mostró cuatro subpoblaciones hipotéticas representadas por diferentes colores.

Análisis de haplotipos

La estructura del haplotipo basada en los marcadores SNP para cada cromosoma de trigo se evaluó utilizando el software Haploview 4.2. (Barrett et al., 2004). El software define bloques de haplotipos (HB) y proporciona el número de haplotipos y su longitud física (pb) para cada bloque. Los HB se convirtieron en una tabla usando un script de Python propio disponible en GitHub.

Análisis de asociación

Los análisis de GWAS se realizaron utilizando 4.516 haplotipos (provenientes de 1.268 HB) y 495 marcadores genéticos / SNP informativos anclados al genoma del trigo. Para los análisis se utilizó el método SUPER (Wang et al., 2014) implementados en el paquete R GAPIT (Lipka et al., 2012). Para reducir asociaciones espurias se utilizó en el modelo la estructura genética en la población (valores Q). A partir del GWAS para cada carácter, se seleccionó haplotipos / marcadores que fueron significativos (P < 0,05) en cuatro ambientes, con al menos un ambiente con diferencias altamente significativas (P < 0,001). Todos los haplotipos / marcadores que satisfacen estos criterios son presentados en la tabla que esta debajo.

Figura 2: Tamaños y posición de los bloques de haplotipos (HB) en cada cromosoma para la colección de trigo hexaploide argentino. Los HB rojos indican un tamaño > 30 Mb, los tamaños de HB naranjas entre 10 y 30 Mb y los tamaños de HB verdes <10 Mb.

Basado en la fórmula descrita en (Zhang et al., 2018), la probabilidad de que un haplotipo / marcador sea estadísticamente significativo por azar, simultáneamente para cuatro GWAS fue estimado en menos de 1,25E^-07 (0,05 x 0,05 x 0,05 x 0,001). Basado en este número, la probabilidad de al menos un error en los 5.011 haplotipos / SNP se estimó como 1 – (1 -1,25E^-07) 5.011 = 0,00063 (por carácter evaluado).

Caracteres fenotipados en la población hasta el momento y sobre los cuales se realizó la búsqueda de QTL

DE: Días de siembra a espigazón.

AP: Altura de planta.

FEm = Fertilidad de Espiga a madurez (granos/ gr chaff).

NGE: Número de granos por espiga (número).

PMG: Peso de mil Granos (g).

Resultados del análisis GWAS de la población

Carácter	Haplotipo/ SNP	Cromosoma	Inicio (Mb)	Fin (Mb)	Frecuencia (%)	Efecto sobre carácter	Alelo	SNP	Azul 2013	Azul 2014	Balcarce 2013	Balcarce 2014	Balcarce 2015	Marcos Juárez 2011	Marcos Juárez 2012	Marcos Juárez 2013	Marcos Juárez 2014	Marcos Juárez 2015	Marcos Juárez 2016	Colocalización	Referencia
FEm	B32-Hap4	1A	482,3	487	6	Aumenta	CCTTCTTAC	AX94938408, AX95024082, AX94644800, AX94507352, AX95120675, AX94448644, AX94997258, AX95629264, AX94757176	*	ns	*	*	**	-	ns	ns	ns	ns	ns	_	Basile et al., 2019
FEm	B19-Hap3	2A	70,2	72,9	12	Aumenta	GTCG	AX94639168, AX95096480, AX94381449, AX94400797	*	ns	*	*	ns	-	**	ns	*	ns	ns	_	Basile et al., 2019
FEm	B23-Hap1	2A	83,8	84,5	52	Disminuye	AT	AX95631188, AX94466696	*	*	*	*	ns	-	*	ns	ns	*	*	_	Basile et al., 2019
FEm	B26-Hap3	2A	102	102,7	36	Aumenta	AAG	AX94880269, AX95164703, AX94669822	*	**	**	*	ns	-	ns	ns	ns	ns	*	_	Basile et al., 2019
FEm	B30-Hap4	2A	165,8	182,1	7	Aumenta	TTCCGTCC	AX94774467, AX94576255, AX94849076, AX94692672, AX95115244, AX94448613, AX94724618, AX94577367	**	ns	*	*	ns	-	ns	*	ns	ns	ns	_	Basile et al., 2019
FEm	B49-Hap2	2A	704,8	705,8	15	Aumenta	GC	AX94720460, AX94399675	*	*	*	**	*	-	ns	ns	ns	ns	ns	NKS	Basile et al., 2019
FEm	AX94874921	2A	707,1	-	16	Aumenta	A	AX94874921	ns	ns	ns	ns	ns	-	**	ns	*	*	*	_	Basile et al., 2019
FEm	B55-Hap1	2A	716,8	718,9	12	Aumenta	CAATC	AX95096362, AX94982819, AX94661746, AX94535413, AX94433820	*	***	**	*	*	-	ns	ns	ns	ns	ns	_	Basile et al., 2019
FEm	B14-Hap4	3B	23	24	6	Aumenta	GGTC	AX94624219, AX95189982, AX94413646, AX94873710	ns	ns	**	*	*	-	**	ns	ns	*	ns	_	Basile et al., 2019
FEm	AX94869767	4A	606,4	-	18	Aumenta	C	AX94869767	*	ns	*	*	ns	-	*	*	ns	*	*	_	Basile et al., 2019
FEm	B35-Hap3	4A	625,7	625,9	23	Aumenta	GT	AX94952227, AX94629424	**	*	**	*	*	-	ns	ns	ns	ns	ns	_	Basile et al., 2019
FEm	B33-Hap4	5A	445,2	445,2	7	Aumenta	GC	AX95632187, AX94682497	**	*	*	*	ns	-	ns	ns	ns	ns	ns	PH	Basile et al., 2019
FEm	B43-Hap1	5A	476,4	476,7	15	Aumenta	GACCGCG	AX95132574, AX94876698, AX94638131, AX94983398, AX94955528, AX94430148, AX95114243	*	ns	*	*	ns	-	ns	**	ns	*	ns	_	Basile et al., 2019
FEm	B24-Hap2	6A	205,1	233,3	17	Aumenta	TCAA	AX95141224, AX94593271, AX94493694, AX95652741	***	*	*	ns	ns	-	ns	ns	ns	ns	*	TKW	Basile et al., 2019
FEm	B28-Hap4	6A	448,7	454,6	9	Disminuye	GATC	AX95074798, AX94441458, AX95076677, AX94912807	*	*	*	**	*	-	*	ns	ns	ns	ns	_	Basile et al., 2019
FEm	B29-Hap2	6A	455,6	467	25	Aumenta	GATC	AX95074798, AX94441458, AX95076677, AX94912807	***	ns	*	*	ns	-	ns	ns	*	ns	*	_	Basile et al., 2019
FEm	B36-Hap2	7A	119	126	10	Aumenta	CCGG	AX94410775, AX94436598, AX94578662, AX94404264	*	ns	*	**	*	-	ns	ns	ns	ns	*	_	Basile et al., 2019
PMG	B5-Hap3	2D	17,6	18,2	7	Disminuye	TGA	AX94672889, AX94814880, AX95098966	*	*	ns	ns	ns	-	ns	ns	*	*	**	_	Basile et al., 2019
PMG	B12-Hap3	3A	46,7	52,6	5	Disminuye	CCGACACTCCTA	AX94494425, AX94947888, AX94946504, AX94660985, AX95252995, AX94429024, AX94567917, AX94954991, AX94994948, AX94713555, AX94821666, AX94718027	ns	*	ns	*	*	-	**	*	*	ns	ns	_	Basile et al., 2019
PMG	AX95257035	3A	686,8	-	11	Aumenta	T	AX95257035	ns	ns	ns	ns	ns	-	*	ns	***	**	*	_	Basile et al., 2019
PMG	B111-Hap4	3B	817,4	817,8	11	Aumenta	CCCC	AX94758693, AX94799334, AX94401378, AX95131891	ns	ns	ns	*	ns	-	**	ns	*	*	ns	PH	Basile et al., 2019
PMG	AX94459169	6A	0,6	-	30	Aumenta	C	AX94459169	ns	**	*	ns	ns	-	ns	*	***	***	**	_	Basile et al., 2019
PMG	B20-Hap3	6A	63,8	74	21	Disminuye	TTCAGCGAGGGGTCTCGGA	AX94684858, AX94600197, AX95008689, AX95012251, AX94815030, AX94396601, AX94722330, AX94840852, AX95142812, AX95025823, AX95179502, AX94422265, AX94494618, AX94790181, AX94449290, AX94774196, AX95258743, AX95022356, AX95631090	ns	ns	*	ns	ns	-	ns	ns	*	**	*	_	Basile et al., 2019
PMG	B21-Hap3	6A	74,5	101,3	20	Disminuye	TCATTTTCGTTGC	AX94664414, AX94961629, AX94640976, AX94395941, AX95246731, AX94683058, AX94977405, AX94942752, AX95256931, AX94490150, AX94795446, AX95145282, AX95012377	ns	ns	*	ns	ns	-	ns	ns	*	**	*	_	Basile et al., 2019
PMG	B24-Hap2	6A	205,1	233,3	17	Disminuye	TCAA	AX95141224, AX94593271, AX94493694, AX95652741	ns	ns	**	ns	ns	-	*	ns	*	***	*	FE	Basile et al., 2019
PMG	B38-Hap3	7B	626,1	627,6	5	Aumenta	TG-TC	AX94754235, AX94843008, AX95171526, AX94419535, AX94746769	ns	***	**	ns	ns	-	ns	*	*	ns	**	_	Basile et al., 2019
PMG	B60-Hap2	7B	702,3	703,7	27	Aumenta	TT	AX94498540, AX94700055	ns	ns	ns	*	ns	-	*	*	**	*	*	_	Basile et al., 2019
PMG	B60-Hap3	7B	702,3	703,7	15	Aumenta	CT	AX94498540, AX94700055	ns	ns	*	ns	ns	-	*	*	**	**	**	_	Basile et al., 2019
NGE	B49-Hap2	2A	704,8	705,8	15	Aumenta	GC	AX94720460, AX94399675	*	ns	*	**	**	-	ns	ns	*	ns	ns	FE	Basile et al., 2019
NGE	B19-Hap5	4A	231	349,3	13	Aumenta	CACAGT	AX94392668, AX94728695, AX94606134, AX94394855, AX94661891, AX94482222	*	**	ns	ns	ns	-	**	*	*	ns	*	_	Basile et al., 2019
DE	B76-Hap2	1B	643,1	645,7	35	Aumenta	TCT	AX94439319, AX94766122, AX95017951	*	**	ns	ns	ns	**	*	*	ns	*	*	_	Basile et al., 2019
DE	B84-Hap3	1B	667,2	667,8	17	Disminuye	CGT	AX95199577, AX94689744, AX94803292	ns	ns	**	**	*	ns	*	*	*	ns	ns	_	Basile et al., 2019
DE	B89-Hap4	1B	676,8	678	6	Disminuye	-GG	AX94431388, AX94537816, AX94546627	ns	ns	*	**	*	*	*	ns	*	*	ns	_	Basile et al., 2019
DE	B40-Hap4	2B	162,9	166,9	10	Aumenta	TTTTGTATA	AX94622328, AX94450544, AX94655193, AX94755547, AX95213611, AX95081080, AX94499577, AX95007105, AX94589917	*	**	ns	ns	ns	ns	*	ns	*	*	ns	_	Basile et al., 2019
DE	B62-Hap1	2B	564,2	569	10	Aumenta	ACAAAA	AX95146301, AX94459397, AX95685439, AX94967288, AX95235626, AX94770158	*	**	ns	ns	ns	*	ns	ns	ns	*	ns	_	Basile et al., 2019
DE	Ppd-D1 sensitive	2D	34	-	42	Aumenta	sensitive	Ppd-D1	*	*	*	*	*	**	***	**	***	***	**	_	Basile et al., 2019
DE	B31-Hap1	3A	504,8	507,5	59	Disminuye	AGG	AX94818694, AX94989495, AX94664169	ns	ns	*	ns	*	**	*	*	*	*	*	_	Basile et al., 2019
DE	B49-Hap3	3A	631,2	633,1	12	Disminuye	GTA	AX94983266, AX94480950, AX94590370	**	ns	*	*	ns	*	*	ns	*	**	*	_	Basile et al., 2019
DE	B59-Hap3	3A	695,5	695,7	19	Aumenta	GA	AX94460524, AX94829707	ns	*	ns	ns	ns	**	*	**	*	*	ns	_	Basile et al., 2019
DE	B60-Hap4	3A	699,4	700,6	10	Aumenta	GACG	AX95083017, AX94700391, AX94586183, AX95230073	ns	**	ns	ns	ns	**	*	***	**	*	ns	_	Basile et al., 2019
DE	B7-Hap1	3D	518,2	560,1	54	Disminuye	CGCGAATATCTAGCCT	AX94918512, AX94838180, AX95014681, AX94749865, AX94643137, AX94629154, AX94462026, AX94508902, AX94762786, AX94401224, AX94804577, AX94505336, AX94524892, AX95078497, AX94475658, AX94965337	*	*	ns	ns	ns	*	*	**	*	*	*	_	Basile et al., 2019
DE	B75-Hap4	5B	597,2	601,4	11	Disminuye	TATGTTCGCTTCCG	AX94472448, AX94825873, AX95126299, AX94494539, AX94534515, AX94435670, AX94419463, AX94526460, AX94855957, AX95234715, AX95141741, AX95257158, AX94955787, AX95131986	*	ns	ns	ns	ns	*	*	ns	*	**	ns	_	Basile et al., 2019
DE	AX94610041	6A	13,8	-	46	_	A	AX94610041	*	*	**	*	*	**	ns	*	*	*	ns	_	Basile et al., 2019
DE	B43-Hap1	6A	591,7	592,5	61	Disminuye	TGTACT	AX94439933, AX94621070, AX95152390, AX94499400, AX94765421, AX94750793	ns	**	ns	ns	ns	*	*	**	*	*	*	_	Basile et al., 2019
DE	B26-Hap3	6B	157,6	157,8	11	Aumenta	ACG	AX95231652, AX94976370, AX94918690	*	**	ns	ns	ns	ns	ns	ns	*	*	**	PH	Basile et al., 2019
DE	B24-Hap2	7A	68	70,2	8	Aumenta	CAAC	AX94880471, AX94952518, AX94923482, AX94915156	ns	ns	*	**	*	*	ns	**	*	*	ns	_	Basile et al., 2019
AP	B38-Hap3	1A	508,6	510,4	16	Aumenta	CTAATTTG	AX95194961, AX94775918, AX94519549, Glu-A1_2*, Glu-A1_1, Glu-A1_null, AX94509092, AX95192108	*	**	ns	ns	ns	*	ns	ns	*	ns	ns	_	Basile et al., 2019
AP	B17-Hap4	1B	121	124	5	Aumenta	C-TAACAC	AX94479105, AX94923277, AX95215734, AX94819793, AX95630584, AX95233201, AX95117274, AX94511623	*	*	*	**	*	***	*	*	*	*	**	_	Basile et al., 2019
AP	AX94510167	1B	548,7	-	21	Aumenta	C	AX94510167	ns	*	ns	**	*	**	ns	ns	*	ns	ns	_	Basile et al., 2019
AP	B54-Hap1	1B	580,5	581,2	43	Disminuye	GAT	AX94417290, AX94963680, AX94858556	*	**	ns	*	*	*	ns	ns	***	***	ns	_	Basile et al., 2019
AP	Lr10	1D	8,6	-	10	Aumenta	TTA	Lr 10_362	*	*	**	ns	*	ns	*	ns	*	*	ns	_	Basile et al., 2019
AP	B5-Hap4	1D	11,6	11,9	19	Disminuye	TCG	AX95069958, AX94514240, AX95653181	*	**	ns	*	*	*	ns	*	*	*	*	_	Basile et al., 2019
AP	B10-Hap4	1D	31,1	32,5	10	Aumenta	TTGC	AX94450337, AX94886765, AX94603350, AX95235028	*	ns	***	*	ns	*	*	ns	ns	ns	ns	_	Basile et al., 2019
AP	B39-Hap1	2A	611,2	611,9	70	Disminuye	ACCG	AX94929514, AX95166962, AX95076860, AX95238815	**	ns	**	ns	ns	*	ns	*	ns	ns	*	_	Basile et al., 2019
AP	B48-Hap3	2A	701	702,1	15	Disminuye	TGAAT	AX94881363, AX94401392, AX94619928, AX94526179, AX94486441	*	***	*	ns	*	*	ns	ns	*	*	ns	_	Basile et al., 2019
AP	B56-Hap4	2B	469,2	476,6	6	Aumenta	C-	AX94917137, AX95133917	ns	*	**	*	ns	*	ns	*	ns	**	*	_	Basile et al., 2019
AP	B79-Hap3	2B	664,2	664,9	5	Aumenta	TA-	AX94950749, AX95199286, AX95069755	*	ns	**	*	ns	**	ns	*	ns	**	*	_	Basile et al., 2019
AP	AX94687989	2B	702,2	-	52	Aumenta	T	AX94687989	ns	**	ns	ns	ns	ns	*	ns	**	*	ns	_	Basile et al., 2019
AP	B97-Hap1	2B	719,5	719,5	38	Disminuye	CAT	AX94645156, AX94982580, AX94706037	ns	**	ns	ns	ns	ns	*	ns	**	*	*	_	Basile et al., 2019
AP	B114-Hap4	2B	762	763,9	8	Aumenta	C-AAA	AX94868242, AX94431230, AX95097760, AX95191464, AX94912106	**	*	*	ns	*	ns	ns	ns	*	ns	ns	_	Basile et al., 2019
AP	AX94585596	2B	776,4	-	15	Aumenta	C	AX94585596	*	**	ns	ns	*	**	*	*	*	ns	ns	_	Basile et al., 2019
AP	AX94624485	2B	776,8	-	10	Aumenta	G	AX94624485	*	*	*	ns	ns	**	*	*	ns	ns	ns	_	Basile et al., 2019
AP	B122-Hap3	2B	777,1	777,2	6	Aumenta	-A	AX94869081, AX94764862	*	*	*	ns	*	***	**	*	*	*	ns	_	Basile et al., 2019
AP	B22-Hap2	3A	391,5	393,4	53	Aumenta	GC	AX94393045, AX94823297	*	*	ns	*	ns	*	**	*	*	ns	*	_	Basile et al., 2019
AP	AX95090222	3A	700,6	-	18	Aumenta	G	AX95090222	**	ns	ns	*	ns	ns	**	ns	*	ns	ns	_	Basile et al., 2019
AP	AX95083205	3A	743,9	-	46	Aumenta	C	AX95083205	**	*	ns	ns	*	ns	ns	*	*	ns	ns	_	Basile et al., 2019
AP	B6-Hap1	3B	164,4	170,8	65	Disminuye	TCACG	AX94415818, AX94512569, AX94586240, AX94707486, AX95629899	*	*	*	ns	*	ns	*	*	**	**	*	_	Basile et al., 2019
AP	B55-Hap4	3B	511,1	513,6	6	Disminuye	CCCTT	AX94541525, AX94453315, AX94990396, AX94853100, AX94547219	**	*	ns	ns	*	ns	ns	ns	ns	*	*	_	Basile et al., 2019
AP	B60-Hap6	3B	541,5	544,5	5	Aumenta	GA-G-CC-T	AX95141130, AX95685009, AX94701179, AX95630480, AX94829564, AX94900436, AX94434519, AX94445502, AX94929428	*	ns	*	*	ns	**	*	*	*	*	ns	_	Basile et al., 2019
AP	B109-Hap2	3B	796	799,1	9	Disminuye	CTGTTGACGATG	AX95681901, AX94724702, AX95085345, AX94613383, AX95229979, AX94460257, AX95630742, AX94991264, AX94967827, AX95210310, AX94528506, AX94512236	*	**	*	ns	ns	ns	ns	ns	ns	*	*	_	Basile et al., 2019
AP	B111-Hap4	3B	817,4	817,8	11	Aumenta	CCCC	AX94758693, AX94799334, AX94401378, AX95131891	***	ns	*	*	**	***	*	**	*	*	*	TKW	Basile et al., 2019
AP	B57-Hap6	4A	738,7	739,7	9	Disminuye	ATTAG	AX94416122, AX95249633, AX95150738, AX95652066, AX94511022	*	ns	ns	**	ns	**	ns	ns	ns	*	ns	_	Basile et al., 2019
AP	B28-Hap5	4B	612,2	613,2	6	Aumenta	GG-G	AX94617210, AX94652395, AX94783372, AX94750774	*	**	*	*	*	*	*	*	*	*	ns	_	Basile et al., 2019
AP	B36-Hap2	4B	650,7	650,7	57	Disminuye	TGT	AX94484839, AX95096924, AX94521391	**	*	*	*	ns	*	**	**	ns	*	ns	_	Basile et al., 2019
AP	B16-Hap4	5A	33	33,2	5	Aumenta	CCC	AX94653931, AX94556600, AX94635713	*	*	*	*	*	**	**	ns	ns	ns	ns	_	Basile et al., 2019
AP	B33-Hap4	5A	445,2	445,2	7	Disminuye	GC	AX95632187, AX94682497	ns	***	*	ns	ns	*	ns	ns	ns	*	*	FE	Basile et al., 2019
AP	B54-Hap3	5A	516,1	527,9	5	Aumenta	CACTGAAG	AX94397871, AX94509108, AX94908260, AX94415346, AX94606396, AX94462177, AX95629459, AX94651425	ns	*	*	**	**	***	ns	ns	*	*	*	_	Basile et al., 2019
AP	B82-Hap2	5A	611,6	613,5	10	Aumenta	CACC	AX94413482, AX94423469, AX94437035, AX94747224	*	ns	*	ns	ns	*	***	ns	*	ns	*	_	Basile et al., 2019
AP	B26-Hap2	5B	430,7	430,7	17	Aumenta	CG	AX94432329, AX94784692	**	*	ns	*	*	*	*	ns	ns	ns	*	_	Basile et al., 2019
AP	AX94550178	5B	455,7	-	46	Aumenta	G	AX94550178	ns	ns	***	*	*	*	ns	ns	*	ns	ns	_	Basile et al., 2019
AP	B92-Hap4	5B	683,5	684	5	Aumenta	C-	AX94861020, AX94597114	*	ns	*	*	ns	**	*	*	*	ns	**	_	Basile et al., 2019
AP	B2-Hap5	6A	0,6	0,8	5	Aumenta	-C	AX95630434, AX94746756	*	ns	**	**	*	ns	ns	ns	*	*	ns	_	Basile et al., 2019
AP	B4-Hap2	6A	2,2	2,7	26	Aumenta	CGCC	AX94786709, AX95630503, AX95209203, AX95148675	*	ns	*	*	**	ns	*	ns	ns	*	ns	_	Basile et al., 2019
AP	B4-Hap3	6A	2,2	2,7	17	Disminuye	CATC	AX94786709, AX95630503, AX95209203, AX95148675	**	*	*	ns	*	ns	*	ns	*	**	*	_	Basile et al., 2019
AP	B16-Hap1	6A	48,6	49,8	57	Aumenta	CCC	AX94889521, AX95233516, AX94739464	ns	ns	ns	*	ns	*	*	ns	**	*	**	_	Basile et al., 2019
AP	B17-Hap3	6A	50,3	51,4	33	Disminuye	CCA	AX94472732, AX95184774, AX94579590	ns	*	*	*	ns	**	ns	*	*	**	ns	_	Basile et al., 2019
AP	B54-Hap5	6A	610	610,2	6	Aumenta	-G	AX94900530, AX95188728, AX94554119	ns	ns	*	*	ns	***	ns	**	ns	ns	ns	_	Basile et al., 2019
AP	B7-Hap2	6B	19,8	20,7	82	Disminuye	CAC	AX94606720, AX95152971, AX94679404	**	***	**	*	ns	*	***	*	*	*	*	_	Basile et al., 2019
AP	B20-Hap4	6B	124,4	126,1	6	Aumenta	CCC	AX94725996, AX95154560, AX95069655	*	ns	ns	ns	ns	**	*	*	ns	*	*	_	Basile et al., 2019
AP	B25-Hap4	6B	151,4	156,4	25	Disminuye	TCATAGGCCTTGAGTTC	AX94476270, AX94489861, AX94594212, AX94592155, AX95228304, AX94746774, AX95251482, AX95224228, AX94436738, AX94925666, AX94723474, AX95257540, AX95254919, AX94814333, AX95150132, AX94933359, AX94606831	*	**	*	*	**	ns	ns	ns	*	*	ns	_	Basile et al., 2019
AP	B26-Hap3	6B	157,6	157,8	11	Disminuye	ACG	AX95231652, AX94976370, AX94918690	*	***	ns	*	ns	*	*	*	ns	*	***	HD	Basile et al., 2019
AP	B31-Hap2	6B	195,3	197,8	5	Aumenta	-G	AX94507593, AX94510067	*	ns	**	**	*	**	ns	ns	*	*	*	_	Basile et al., 2019
AP	AX94943227	6B	234,8	-	17	Aumenta	C	AX94943227	**	***	**	*	*	*	***	*	*	*	*	_	Basile et al., 2019
AP	B47-Hap3	6B	480,4	491,6	24	Disminuye	GGTCGTTGCCAGC	AX94485266, AX94999452, AX94504202, AX94501866, AX94417160, AX94459292, AX94596473, AX94878625, AX94647376, AX94523508, AX94690961, AX94916954, AX95197645	ns	ns	ns	*	**	ns	ns	ns	*	ns	*	_	Basile et al., 2019
AP	AX94476474	7A	561,6	-	14	Aumenta	T	AX94476474	**	*	*	ns	ns	ns	ns	**	*	*	ns	_	Basile et al., 2019
AP	B14-Hap4	7B	59,6	61,6	22	Disminuye	ATAC	AX94590671, AX94587603, AX94758128, AX95222995	***	ns	ns	ns	*	ns	*	ns	ns	*	ns	_	Basile et al., 2019
AP	B76-Hap3	7B	743,5	743,6	10	Disminuye	CA	AX94593529, AX94770939	**	***	*	*	ns	*	ns	*	**	**	*	_	Basile et al., 2019

En la tabla solo se presentan los SNP que pasaron los criterios de selección en GWAS. ns = no significativo, * P <0.05, ** P <0.001, *** P <0.0001, “–” = no disponible.

Referencias

Barrett, J. C., Fry, B., Maller, J., & Daly, M. J. (2004). Haploview: analysis and visualization of LD and haplotype maps. Bioinformatics, 21(2), 263–265. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bth457
Basile, S. M. L., Ramírez, I. A., Crescente, J. M., Conde, M. B., Demichelis, M., Abbate, P., Rogers, W. J., Pontaroli, A. C., Helguera, M., & Vanzetti, L. S. (2019). Haplotype block analysis of an Argentinean hexaploid wheat collection and GWAS for yield components and adaptation. BMC Plant Biology, 19(1). https://doi.org/10.1186/s12870-019-2015-4
François O. (2016). Running structure-like population genetic analyses with R. http://membres-timc.imag.fr/Olivier.Francois/tutoRstructure.pdf
Lipka, A. E., Tian, F., Wang, Q., Peiffer, J., Li, M., Bradbury, P. J., Gore, M. A., Buckler, E. S., & Zhang, Z. (2012). GAPIT: genome association and prediction integrated tool. Bioinformatics, 28(18), 2397–2399. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bts444
‌Vanzetti, L. S., Yerkovich, N., Chialvo, E., Lombardo, L., Vaschetto, L., & Helguera, M. (2013). Genetic structure of Argentinean hexaploid wheat germplasm. Genetics and Molecular Biology, 36(3), 391–399. https://doi.org/10.1590/s1415-47572013000300014
Wang, Q., Tian, F., Pan, Y., Buckler, E. S., & Zhang, Z. (2014). A SUPER Powerful Method for Genome Wide Association Study. PLoS ONE, 9(9), e107684. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0107684
Zhang, J., Gizaw, S. A., Bossolini, E., Hegarty, J., Howell, T., Carter, A. H., Akhunov, E., & Dubcovsky, J. (2018). Identification and validation of QTL for grain yield and plant water status under contrasting water treatments in fall-sown spring wheats. Theoretical and Applied Genetics, 131(8), 1741–1759. https://doi.org/10.1007/s00122-018-3111-9

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Baguette 10 x Klein Chajá

Ivan Muñoz — Thu, 16 Sep 2021 05:25:57 +0000

MAPEO GENÉTICO

Baguette 10 x Klein Chajá

Esta población de mapeo se desarrolló originalmente para el estudio de la herencia de la fertilidad de espiga. Los padres de la población fueron seleccionados a partir de la evaluación de un set de genotipos locales (Mirabella et al., 2015) en el cual se caracterizaron y describieron como contrastantes para el carácter. La población de 146 líneas endocriadas recombinantes (RIL) fue evaluada en sucesivos ciclos agrícolas y en dos localidades. Con esa información sumado al desarrollo de un mapa de ligamiento, se procedió con el mapeo de QTL de fertilidad de espiga y caracteres asociados al rendimiento (Alonso et al., 2021).

Información de los Padres:

Baguette 10: (pedigrí: ARCHE/GENIAL). Liberada por Nidera en 2000. Su espiga es compacta, corta, densa y posee glumas y raquis muy fino y liviano.

Klein Chajá: (pedigrí: NINJING/3/BUC’S’//H697/DKBL). Liberada en 2002. Su espiga es larga, laxa con alto número de espiguillas y granos por espiga. La estructura de chaff es pesada.

Tipo de Población: Biparental; Líneas endocriadas recombinantes.

Tamaño de la Población: 80 genotipos

Origen: EEA INTA Balcarce. Grupo de trabajo de la Dra. Ana Clara Pontaroli

Plataforma de genotipado: Axiom® 35K SNP Wheat Breeder’s Array (Affimetrix)

Figura descriptiva de la población tomada de Alonso et al., 2021

Caracteres fenotipados en la población hasta el momento y sobre los cuales se realizó la búsqueda de QTL

AP: Altura de planta.

DF: Días de siembra a floración.

FEm = Fertilidad de Espiga a madurez (granos/ gr CH-BLUPs).

PMG: Peso de mil Granos (g).

Resultados del mapeo de QTL en la población Baguette 10 x Klein Chajá

Carácter	Localidad	Año	Ambiente	Unidad Exp.	Cromosoma	Marcador Pico	Posición (cM)	LOD	Donor (1)	Efecto aditivo (2)	R²	Gen Candidato
PMG	Balcarce	2016	Campo 2.ª fecha siembra	Surco	1A	AX-94995317	21,91	4	B10	1,86	0,16	_
PMG	Balcarce	2015	Campo	Parcela	1B	AX-95190390	23,21	3,4	B10	1,13	0,13	_
FEm	Balcarce	2016	Campo 1.ª fecha siembra	Surco	1B	{AX-94450773, AX-94383420, AX-94526379, AX-94545824, AX-94533843}:{AX-94580006, AX-94572866, AX-94897165, AX-94518238}	37,31	4,1	KCH	5,81	0,2	_
DF	Balcarce	2016	Campo 2.ª fecha siembra	Surco	1B	{AX-95630094}:{AX-94768738}	96,61	5,97	B10	1,09	0,2	_
DF	Balcarce	2016	Campo 1.ª fecha siembra	Surco	1B	{AX-95105440}	125,01	2,52	B10	0,85	0,09	_
FEm	Balcarce	2014	Campo	Parcela	1D	AX-94807169, (AX-94897619)	0,01	3,06	B10	3,68	0,12	_
DF	Balcarce	2014	Campo	Parcela	2A	AX-94910420	122,51	3,56	B10	1,31	0,1	_
DF	Balcarce	2016	Campo 2.ª fecha siembra	Surco	2A	AX-94910420	122,51	2,75	B10	0,69	0,08	_
DF	Balcarce	2013	Campo	Parcela	2A	AX-94520484	123,21	3,51	B10	1,13	0,16	_
FEm	Balcarce	2014	Campo	Parcela	2B	AX-94396682	32,61	2,96	B10	4,19	0,16	_
FEm	Marcos Juárez	2017	Campo	Parcela	2B	AX-95097760	110,01	3,26	B10	4,23	0,11	_
FEm	Balcarce	2016	Campo 1.ª fecha siembra	Surco	2D	AX-94823670	138,61	3,21	B10	5,76	0,22	_
FEm	Balcarce	2016	Campo 2.ª fecha siembra	Surco	2D	AX-94850234, (AX-95232269), (AX-94772717), (AX-94517735), (AX-94496067), (AX-94816080), (AX-94501170), (AX-94470389)	150,41	5,2	B10	9,15	0,17	_
FEm	Balcarce	2015	Campo	Parcela	2D	AX-94850234, (AX-95232269), (AX-94772717), (AX-94517735), (AX-94496067), (AX-94816080), (AX-94501170), (AX-94470389)	150,41	5,2	B10	6,46	0,14	_
FEm	BLUP	_	_	_	2D	AX-94850234, (AX-95232269), (AX-94772717), (AX-94517735), (AX-94496067), (AX-94816080), (AX-94501170), (AX-94470389)	150,41	2,72	B10	5,08	0,12	_
PMG	Balcarce	2015	Campo	Parcela	2D	AX-94850234, (AX-95232269), (AX-94772717), (AX-94517735), (AX-94496067), (AX-94816080), (AX-94501170), (AX-94470389)	150,41	4,28	KCH	1,79	0,07	_
PMG	BLUP	_	_	_	2D	AX-94850234, (AX-95232269), (AX-94772717), (AX-94517735), (AX-94496067), (AX-94816080), (AX-94501170), (AX-94470389)	150,41	3,58	KCH	1,82	0,12	_
PMG	Balcarce	2016	Campo 2.ª fecha siembra	Surco	2D	AX-94850234, (AX-95232269), (AX-94772717), (AX-94517735), (AX-94496067), (AX-94816080), (AX-94501170), (AX-94470389)	150,41	2,53	KCH	2,33	0,09	_
PMG	Balcarce	2014	Campo	Parcela	2D	AX-94850234, (AX-95232269), (AX-94772717), (AX-94517735), (AX-94496067), (AX-94816080), (AX-94501170), (AX-94470389)	150,41	3,94	KCH	3,11	0,13	_
PMG	Balcarce	2016	Campo 1.ª fecha siembra	Surco	2D	AX-94850234, (AX-95232269), (AX-94772717), (AX-94517735), (AX-94496067), (AX-94816080), (AX-94501170), (AX-94470389)	150,41	5,06	KCH	3,23	0,15	_
PMG	Balcarce	2017	Campo 2.ª fecha siembra	Surco	2D	AX-94850234, (AX-95232269), (AX-94772717), (AX-94517735), (AX-94496067), (AX-94816080), (AX-94501170), (AX-94470389)	150,41	4,54	KCH	3,36	0,13	_
FEm	Balcarce	2017	Campo 2.ª fecha siembra	Surco	4A	AX-94966306	22,91	3,01	B10	3,19	0,11	_
FEm	Marcos Juárez	2017	Campo	Parcela	4A	AX-94674955	23,61	3,23	B10	4,02	0,11	_
DF	BLUP	_	_	_	4B	AX-95249462	7,61	2,54	KCH	0,43	0,09	_
AP	Balcarce	2015	Campo	Parcela	4D	Rht-D1	13,01	8,67	B10	10,21	0,4	Rht-D1
AP	Balcarce	2017	Campo 1.ª fecha siembra	Surco	4D	Rht-D1	16,01	9,11	B10	8,62	0,45	Rht-D1
AP	BLUP	_	_	_	4D	Rht-D1	17,01	5,15	B10	5,62	0,2	Rht-D1
AP	Balcarce	2014	Campo	Parcela	4D	Rht-D1	18,01	6,84	B10	7,3	0,3	Rht-D1
AP	Marcos Juárez	2017	Campo	Parcela	4D	Rht-D1	23,01	6,86	B10	6,73	0,29	Rht-D1
AP	Balcarce	2017	Campo 2.ª fecha siembra	Surco	4D	Rht-D1	23,01	3,84	B10	5,35	0,13	Rht-D1
AP	Balcarce	2013	Campo	Parcela	4D	Rht-D1	24,61	6,15	B10	5,61	0,2	Rht-D1
PMG	Marcos Juárez	2017	Campo	Parcela	4D	AX-94646444	102,11	3	B10	2,52	0,31	Rht-D1
AP	BLUP	_	_	_	5A	AX-94927881	104,41	3,18	KCH	3,4	0,08	_
DF	Marcos Juárez	2017	Campo	Parcela	5A	{AX-94730618}:{AX-94859739}	128,41	4,02	B10	2,16	0,11	_
DF	Balcarce	2016	Campo 1.ª fecha siembra	Surco	5A	{AX-94945628}:AX-94428215, AX-94420428	141,01	3	B10	0,83	0,09	_
PMG	Balcarce	2014	Campo	Parcela	5A	Vrn-A1	153,21	3,7	B10	1,64	0,14	_
PMG	BLUP	_	_	_	5A	Vrn-A1	155,71	3,34	B10	0,92	0,13	_
DF	Balcarce	2017	Campo 2.ª fecha siembra	Surco	5A	{AX-94423469, AX-94645340}:{AX-95629610, AX-94987657}	178,81	4,03	B10	1,39	0,13	_
DF	Balcarce	2015	Campo	Parcela	5A	{AX-94423469, AX-94645340}:{AX-95629610, AX-94987657}	182,61	4,75	B10	0,92	0,18	_
DF	Balcarce	2017	Campo 2.ª fecha siembra	Surco	5B	AX-94414150	8,01	3,74	B10	1,29	0,11	_
FEm	Balcarce	2015	Campo	Parcela	5B	AX-95210238, (AX-94897804)	10,21	3,1	KCH	2,92	0,11	_
FEm	Balcarce	2014	Campo	Parcela	5B	AX-95210238, (AX-94897804)	11,21	2,69	KCH	3,54	0,11	_
AP	BLUP	_	_	_	5B	AX-95229346	33,61	5,85	B10	5,26	0,16	_
AP	Balcarce	2017	Campo 2.ª fecha siembra	Surco	5B	AX-95229346	33,61	3,69	B10	4,75	0,11	_
PMG	Marcos Juárez	2017	Campo	Parcela	5B	AX-95229346	33,61	3,62	B10	1,83	0,17	_
FEm	BLUP	_	_	_	5B	AX-95229346	33,61	2,88	KCH	2,52	0,11	_
FEm	Marcos Juárez	2017	Campo	Parcela	5B	AX-95229346	33,61	3,03	KCH	3,97	0,1	_
AP	Balcarce	2014	Campo	Parcela	5B	AX-95631111	48,91	4,36	B10	5,3	0,15	_
AP	Balcarce	2013	Campo	Parcela	5B	AX-95631111	50,81	4,4	B10	4,73	0,14	_
AP	BLUP	_	_	_	5B	AX-94831861	114,41	3,46	KCH	3,86	0,1	_
FEm	BLUP	_	_	_	6A	AX-94956725	35,71	2,53	B10	2,81	0,16	_
FEm	Balcarce	2016	Campo 2.ª fecha siembra	Surco	6A	AX-94956725	43,71	2,67	B10	3,98	0,13	_
AP	Balcarce	2014	Campo	Parcela	6A	AX-95189985	55,61	2,97	KCH	4,23	0,1	_
AP	Marcos Juárez	2017	Campo	Parcela	6A	AX-95189985	58,61	3,03	KCH	4,72	0,14	_
DF	Balcarce	2016	Campo 1.ª fecha siembra	Surco	6A	AX-95189985	60,61	4,18	KCH	1,03	0,12	_
DF	Balcarce	2013	Campo	Parcela	6A	AX-95189985	60,71	3,36	KCH	1,09	0,13	_
DF	Marcos Juárez	2017	Campo	Parcela	6A	AX-95189985	60,71	2,62	KCH	1,77	0,07	_
AP	Balcarce	2017	Campo 1.ª fecha siembra	Surco	6A	AX-94444906	79,31	3,6	KCH	4,35	0,1	_
DF	Balcarce	2014	Campo	Parcela	6A	AX-94444906	81,01	3,66	KCH	1,31	0,11	_
DF	Balcarce	2017	Campo 1.ª fecha siembra	Surco	6A	AX-94444906	93,11	2,59	KCH	1,3	0,22	_
DF	Balcarce	2015	Campo	Parcela	6A	AX-94444906	98,11	4,03	KCH	1,28	0,36	_
FEm	Balcarce	2017	Campo 2.ª fecha siembra	Surco	6B	{AX-95009966, AX-94711773, AX-94408662}:{AX-94810169_6B}:{AX-94638771, AX-94805681, AX-95084487, AX-94399591}	39,61	2,69	KCH	3,05	0,1	_
DF	Balcarce	2014	Campo	Parcela	6B	AX-94509919, (AX-94451862), (AX-95148946)	136,91	3,06	KCH	1,38	0,11	_
DF	Balcarce	2017	Campo 2.ª fecha siembra	Surco	6D	{AX-94532403, AX-94511297, AX-94422473, AX-94889337}	236,01	2,95	KCH	1,14	0,09	_
FEm	Balcarce	2015	Campo	Parcela	7A	AX-94698211, (AX-95217657)	69,41	5,91	B10	4,35	0,22	_
PMG	Balcarce	2016	Campo 2.ª fecha siembra	Surco	7A	AX-94698211, (AX-95217657)	75,41	3,67	KCH	1,64	0,19	_
PMG	BLUP	_	_	_	7A	AX-94698211, (AX-95217657)	78,41	3,18	KCH	1,07	0,18	_
FEm	Marcos Juárez	2017	Campo	Parcela	7A	{AX-94430036, AX-95221536}	109,91	3,56	B10	4,24	0,12	_
AP	Balcarce	2013	Campo	Parcela	7B	{AX-95178394}:{AX-94451941, AX-94449644}	78,21	3,24	KCH	3,88	0,1	_
AP	Balcarce	2014	Campo	Parcela	7B	{AX-95178394}:{AX-94451941, AX-94449644}	78,21	2,98	KCH	3,96	0,09	_
DF	Balcarce	2015	Campo	Parcela	7B	{AX-95230468, AX-94434344}	97,81	3,68	B10	0,72	0,12	_
DF	Balcarce	2014	Campo	Parcela	7B	{AX-95230468, AX-94434344}	99,81	4,15	B10	1,46	0,14	_
DF	Marcos Juárez	2017	Campo	Parcela	7B	{AX-95230468, AX-94434344}	101,81	3,86	B10	2,58	0,16	_
DF	Balcarce	2017	Campo 1.ª fecha siembra	Surco	7B	{AX-95230468, AX-94434344}	101,81	3,72	B10	1,12	0,17	_
DF	BLUP	_	_	_	7D	AX-94435697	0,01	4,86	B10	0,59	0,17	_
DF	Marcos Juárez	2017	Campo	Parcela	7D	AX-94435697	4,01	5,25	B10	2,87	0,21	_
DF	Balcarce	2013	Campo	Parcela	7D	AX-94435697	8,01	2,83	B10	1,29	0,21	_
DF	Balcarce	2016	Campo 1.ª fecha siembra	Surco	7D	AX-94435697	9,01	4,95	B10	1,49	0,28	_
DF	Balcarce	2016	Campo 2.ª fecha siembra	Surco	7D	AX-94435697	10,01	4,78	B10	1,37	0,33	_
DF	Balcarce	2015	Campo	Parcela	7D	AX-94435697	13,01	6,74	B10	1,35	0,41	_
DF	Balcarce	2017	Campo 2.ª fecha siembra	Surco	7D	AX-94435697	15,01	3,27	B10	1,99	0,27	_
AP	Balcarce	2015	Campo	Parcela	UNL	AX-94621575	18,01	3,56	KCH	7,23	0,2	_

(1) Padre donador del alelo que incrementa los valores fenotípicos observados, KCH = Klein Chajá y B10 = Baguette 10. (2) El efecto aditivo se expresa en unidades del carácter medido

Referencias

Alonso, M. P., Vanzetti, L. S., Crescente, J. M., Mirabella, N. E., Panelo, J. S., & Pontaroli, A. C. (2021). QTL mapping of spike fertility index in bread wheat. Crop Breeding and Applied Biotechnology, 21(1). https://doi.org/10.1590/1984-70332021v21n1a3
Mirabela, N. E., Abbate, P. E., Ramírez, I. A., & Pontaroli, A. C. (2015). Genetic variation for wheat spike fertility in cultivars and early breeding materials. The Journal of Agricultural Science, 154(1), 13–22. https://doi.org/10.1017/s0021859614001245

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Baguette P. 11 x BIOINTA 2002

Ivan Muñoz — Tue, 29 Jun 2021 21:36:00 +0000

MAPEO GENÉTICO

Baguette P. 11 x BIOINTA 2002

Esta población de mapeo se desarrolló originalmente para el mapeo de QTL relacionados con fertilidad de espiga. Los padres de la población fueron seleccionados a partir de la evaluación de un set de genotipos locales (González et al., 2011) y luego fueron confirmados como contrastantes para los caracteres de interés (Terrile et al., 2017). Una vez desarrollada la población doble haploide y el mapa de ligamiento, se procedió a la detección de QTL para Fertilidad de Espiga y caracteres relacionados (Pretini et al., 2021).

Información de los Padres:

Baguette Premium 11: Pedigrí cerrado y liberada como variedad por la empresa Nidera en Argentina en el año 2004.

BIOINTA 2002: (BPON / CCTP- F7-7792–122 (87)) fue desarrollado por CIMMYT y liberada como variedad en 2006 en Argentina por INTA.

Tipo de Población: Dobles Haploides (DH).

Tamaño de la Población: 81 genotipos.

Origen: EEA INTA Pergamino. Grupo de trabajo de la Dra. Fernanda González.

Plataforma de genotipado: 90K SNPs iSelect Infinium Array.

Figura descriptiva de la población, tomado de Pretini et al., (2021)

Caracteres fenotipados en la población hasta el momento y sobre los cuales se realizó la búsqueda de QTL y genes candidatos

Estructura de espiga

LE = Largo de Espiga (mm).

NEsp = Número de Espiguillas por Espiga (número).

DenEsp = Densidad de espiga (largo de espiga en mm/número de espiguillas).

CH = Chaff (Peso seco de la espiga sin granos a cosecha en mg).

GLPA = Gluma + Lema + Palea + aristas (mg).

R = Raquis (mg).

PSEa = Peso seco de espiga en antesis (mg).

Fertilidad de espiga y componentes de rendimiento

EFF = Eficiencia de Flores Fértiles (número de flores/gr PSEa).

FE = Fertilidad de Espiga (granos/gr PSEa).

FEm = Fertilidad de Espiga a madurez (granos/ gr CH).

FF = Flores Fértiles por Espiga (número).

FFEF = Flores Fértiles por Espiguillas Fértiles (número de flores/espiguillas fértiles).

FFET: Flores Fértiles por Espiguillas Totales (número de flores/ espiguillas totales).

EF: Espiguillas Fértiles por Espiga (número).

NGE: Número de Granos por Espiga (número).

CG: Cuajado de Granos (número de granos/flores).

PG: Peso Grano (mg).

Resultados del mapeo de QTL en la población Baguette P. 11 x BIOINTA 2002

Carácter	Localidad	Año	Ambiente	Unidad Exp.	Cromosoma	Marcador Pico	Posición (cM)	LOD	Donor (1)	Efecto aditivo (2)	R²	RefSeq v1.0 (bp)	Referencia
CH	Pergamino	2012	Campo	Parcela	1A	Tdurum_contig43943_56	1,16	3,77	B2002	1,75	0,12	10,1	Pretini et al., 2021
CH	Pergamino	2012	Campo	Parcela	1A	Excalibur_c10689_254	20,02	2,68	B2002	0,02	0,12	27,36	Pretini et al., 2021
CH	Pergamino	2012	Campo	Parcela	1A	CAP7_c2317_217	28,17	2,81	B2002	0	0,07	48,79	Pretini et al., 2021
CH	Pergamino	2013	Campo	Parcela	1A	Kukri_c49463_154	40,35	2,66	B2002	1,38	0,1	534,93	Pretini et al., 2021
CH	Pergamino	2013	Campo	Parcela	1A	TA001600-1603	41,24	3,43	B2002	0,02	0,13	540,15	Pretini et al., 2021
CH	Pergamino	2015	Campo	Parcela	1A	TA001600-1603	41,24	3,12	B2002	0,02	0,1	540,15	Pretini et al., 2021
CH	Pergamino	2015	Campo	Parcela	1A	RAC875_c11363_624	47,49	3,78	BP11	0,13	0,16	566,69	Pretini et al., 2021
CH	Marcos Juárez	2015	Campo	Parcela	1B	wsnp_Ex_rep_c67299_65844168	114,66	7,26	B2002	0,69	0,19	586,29	Pretini et al., 2021
CH	Marcos Juárez	2015	Campo	Parcela	1B	RAC875_c61512_173	119,09	5	B2002	0,02	0,15	613,32	Pretini et al., 2021
CH	Marcos Juárez	2015	Campo	Parcela	1B	tplb0034p10_1134	210,01	4,46	B2002	0,01	0,17	656,24	Pretini et al., 2021
CN	Pergamino	2012	Campo	Parcela	2A	Ra_c7915_939	0,01	3,8	BP11	0,51	0,08	2,49	Pretini et al., 2021
CN	Pergamino	2013	Campo	Parcela	2A	wsnp_CAP8_c1580_908907	19,59	8,51	BP11	0,01	0,27	33,27	Pretini et al., 2021
CN	Pergamino	2013	Campo	Parcela	2A	BS00012320_51	46,63	2,97	B2002	0,11	0,12	647,9	Pretini et al., 2021
CN	Pergamino	2013	Campo	Parcela	2A	BS00074648_51	75,41	3,08	BP11	2,17	0,1	755,2	Pretini et al., 2021
CN	Pergamino	2015	Campo	Parcela	2A	BS00074648_51	75,41	2,55	B2002	1,45	0,07	755,2	Pretini et al., 2021
CN	Pergamino	2015	Campo	Parcela	2A	BS00091763_51	83,01	3,82	B2002	0,13	0,14	773,2	Pretini et al., 2021
CN	Pergamino	2015	Campo	Parcela	2A	RFL_Contig2972_2819	84,01	6,43	B2002	2,43	0,23	761,31	Pretini et al., 2021
CN	Pergamino	2015	Campo	Parcela	2B	Excalibur_c10376_313	40,54	5,06	B2002	0,15	0,17	65,1	Pretini et al., 2021
FF	Pergamino	2012	Campo	Parcela	2B	wsnp_Ex_rep_c71116_69944350	67,11	7,2	B2002	0,02	0,26	206,11	Pretini et al., 2021
FF	Pergamino	2012	Campo	Parcela	2B	RAC875_c47353_350	71,69	4,57	B2002	6,05	0,17	153,9	Pretini et al., 2021
FF	Pergamino	2013	Campo	Parcela	2B	Excalibur_c12278_1301	75,51	3,26	B2002	0	0,14	246,1	Pretini et al., 2021
FF	Pergamino	2015	Campo	Parcela	2B	wsnp_Ex_c7947_13490335	76,59	3,79	B2002	0,61	0,12	383,3	Pretini et al., 2021
FF	Pergamino	2015	Campo	Parcela	2B	wsnp_Ex_c7947_13490335	76,59	3,46	B2002	0,01	0,14	383,3	Pretini et al., 2021
FF	Pergamino	2015	Campo	Parcela	2B	RAC875_c27297_2153	78,59	3,62	B2002	3,84	0,12	385,2	Pretini et al., 2021
FF	Pergamino	2015	Campo	Parcela	2B	RAC875_c27297_2153	78,59	5,12	B2002	3,09	0,17	385,2	Pretini et al., 2021
FF	Pergamino	2015	Campo	Parcela	2B	wsnp_Ra_c4126_7552133	83,95	5,98	B2002	0,04	0,25	409,25	Pretini et al., 2021
FF	Pergamino	2015	Campo	Parcela	2B	wsnp_Ra_c4126_7552133	83,95	4,11	B2002	0,03	0,14	409,25	Pretini et al., 2021
FFEF	Pergamino	2012	Campo	Parcela	2B	Kukri_rep_c91092_553	84,75	3,83	B2002	0,05	0,14	442,8	Pretini et al., 2021
FFEF	Pergamino	2012	Campo	Parcela	2B	Kukri_rep_c91092_553	84,75	5,32	B2002	0,03	0,16	442,8	Pretini et al., 2021
FFEF	Pergamino	2012	Campo	Parcela	2B	IAAV211	86,14	6,23	B2002	0,74	0,13	553,61	Pretini et al., 2021
FFEF	Pergamino	2012	Campo	Parcela	2B	BS00064318_51	86,84	8,01	B2002	0,78	0,2	686,05	Pretini et al., 2021
FFEF	Pergamino	2013	Campo	Parcela	2B	BS00064318_51	86,84	5,08	B2002	0,05	0,2	686,05	Pretini et al., 2021
FFEF	Pergamino	2013	Campo	Parcela	2B	JD_c10643_840	89,62	4,85	B2002	3,75	0,15	697,1	Pretini et al., 2021
FFEF	Pergamino	2013	Campo	Parcela	2B	JD_c10643_840	90,62	5,08	B2002	3,37	0,13	696,7	Pretini et al., 2021
FFEF	Pergamino	2013	Campo	Parcela	2B	Tdurum_contig12879_264	90,74	8,76	B2002	0,01	0,3	712,6	Pretini et al., 2021
FFEF	Pergamino	2015	Campo	Parcela	2B	Kukri_c16965_1077	101,56	4,25	BP11	0,01	0,12	752,5	Pretini et al., 2021
FFEF	Pergamino	2015	Campo	Parcela	2B	BobWhite_rep_c64068_241	115,32	5,09	B2002	0,04	0,2	775,3	Pretini et al., 2021
FFEF	Pergamino	2015	Campo	Parcela	2B	BobWhite_rep_c64068_241	115,32	5,46	B2002	0,04	0,19	775,3	Pretini et al., 2021
FFEF	Pergamino	2015	Campo	Parcela	2D	wsnp_Ex_c101374_86744680	0,01	2,57	BP11	0,06	0,07	14,25	Pretini et al., 2021
FFET	Pergamino	2012	Campo	Parcela	2D	Kukri_c47664_191	1,14	2,93	BP11	0,03	0,11	17,18	Pretini et al., 2021
FFET	Pergamino	2012	Campo	Parcela	2D	Tdurum_contig17626_210	52,54	3,14	B2002	0,01	0,29	571,54	Pretini et al., 2021
FFET	Pergamino	2012	Campo	Parcela	2D	Tdurum_contig17626_210	60,54	5,02	B2002	0,89	0,24	571,54	Pretini et al., 2021
FFET	Pergamino	2013	Campo	Parcela	2D	Tdurum_contig17626_210	65,54	4,43	B2002	0,77	0,17	571,54	Pretini et al., 2021
FFET	Pergamino	2013	Campo	Parcela	2D	Tdurum_contig17626_210	67,54	6,22	B2002	0,01	0,19	571,54	Pretini et al., 2021
FFET	Pergamino	2013	Campo	Parcela	2D	wsnp_Ra_c54256_57628288	72,71	4,06	B2002	0,02	0,17	619,67	Pretini et al., 2021
FFET	Pergamino	2013	Campo	Parcela	2D	wsnp_Ra_c54256_57628288	73,71	7,41	B2002	0,03	0,33	585,69	Pretini et al., 2021
FFET	Pergamino	2013	Campo	Parcela	2D	RAC875_c11093_174	82,43	10,12	B2002	0,96	0,25	590,07	Pretini et al., 2021
FFET	Pergamino	2015	Campo	Parcela	3A	wsnp_Ra_c2339_4506620	4,4	2,78	BP11	1,76	0,11	10,22	Pretini et al., 2021
FFET	Pergamino	2015	Campo	Parcela	3A	BS00065382_51	32,68	3,21	BP11	0,1	0,09	46,3	Pretini et al., 2021
FFET	Pergamino	2015	Campo	Parcela	3A	GENE-1642_397	74,3	2,89	B2002	0,02	0,11	647,45	Pretini et al., 2021
FFET	Pergamino	2015	Campo	Parcela	3A	wsnp_BG262734A_Ta_2_3	125,09	4,71	BP11	0,08	0,14	688,67	Pretini et al., 2021
EF	Pergamino	2012	Campo	Parcela	3A	wsnp_BG262734A_Ta_2_3	125,09	4,45	BP11	0,09	0,14	688,67	Pretini et al., 2021
EF	Pergamino	2012	Campo	Parcela	3A	Kukri_s117946_404	178,84	3,4	B2002	0,48	0,06	739,7	Pretini et al., 2021
EF	Pergamino	2012	Campo	Parcela	3B	Ex_c5547_2037	62,84	4,47	B2002	0,04	0,17	579,89	Pretini et al., 2021
EF	Pergamino	2013	Campo	Parcela	3B	Ex_c5547_2037	62,84	3,79	B2002	0,05	0,17	579,89	Pretini et al., 2021
EF	Pergamino	2015	Campo	Parcela	3B	wsnp_Ku_c31407_41142340	66,22	5,21	BP11	0	0,16	708,95	Pretini et al., 2021
EF	Pergamino	2015	Campo	Parcela	3B	Kukri_c41129_344	77,69	3,12	BP11	0,01	0,23	744,73	Pretini et al., 2021
EF	Pergamino	2015	Campo	Parcela	3B	Kukri_c41129_344	85,48	4,62	BP11	0	0,16	744,73	Pretini et al., 2021
EF	Pergamino	2015	Campo	Parcela	3B	RAC875_c24504_157	96,41	4,96	BP11	0,14	0,18	760,14	Pretini et al., 2021
EF	Pergamino	2015	Campo	Parcela	3B	GENE-4458_709	135,54	4,93	B2002	0,01	0,15	814,94	Pretini et al., 2021
EF	Pergamino	2015	Campo	Parcela	3B	Kukri_rep_c107195_111	142,95	3,93	B2002	3,47	0,14	702,2	Pretini et al., 2021
GLPA	Pergamino	2012	Campo	Parcela	3B	BS00075879_51	144,35	4,22	B2002	0,13	0,13	817,02	Pretini et al., 2021
GLPA	Pergamino	2012	Campo	Parcela	3B	BobWhite_c45118_495	144,35	7,65	B2002	0,22	0,28	817,02	Pretini et al., 2021
GLPA	Pergamino	2012	Campo	Parcela	3B	BS00079029_51	145,73	3,7	B2002	4,31	0,15	819,5	Pretini et al., 2021
GLPA	Pergamino	2013	Campo	Parcela	3D	GENE-1919_120	27,15	5,54	B2002	3,75	0,16	51	Pretini et al., 2021
GLPA	Pergamino	2013	Campo	Parcela	3D	GENE-1919_120	27,15	4,87	B2002	0,14	0,16	51,04	Pretini et al., 2021
GLPA	Pergamino	2015	Campo	Parcela	3D	GENE-1919_120	28,15	4,29	B2002	4,19	0,16	51,04	Pretini et al., 2021
GLPA	Pergamino	2015	Campo	Parcela	3D	wsnp_Ex_c18250_27065775	29,15	3,4	BP11	1,64	0,11	122,45	Pretini et al., 2021
GLPA	Pergamino	2015	Campo	Parcela	3D	wsnp_Ex_c18250_27065775	30,77	5,31	BP11	1,96	0,22	122,45	Pretini et al., 2021
GLPA	Marcos Juárez	2015	Campo	Parcela	3D	Kukri_c89764_273	30,77	4,91	B2002	0,03	0,18	435,5	Pretini et al., 2021
GLPA	Marcos Juárez	2015	Campo	Parcela	3D	RAC875_c33823_279	32,77	3,14	BP11	1,97	0,11	444,5	Pretini et al., 2021
NGE	Pergamino	2013	Campo	Parcela	3D	D_contig24344_227	41,45	5,24	B2002	0,59	0,12		Pretini et al., 2021
NGE	Pergamino	2013	Campo	Parcela	4A	BS00023007_51	86,21	3,96	B2002	0,59	0,13	717,97	Pretini et al., 2021
NGE	Pergamino	2013	Campo	Parcela	4A	BS00065030_51	87,62	2,74	BP11	0,11	0,11	721,38	Pretini et al., 2021
NGE	Pergamino	2013	Campo	Parcela	4A	BS00065030_51	87,62	2,67	BP11	0,02	0,08	721,38	Pretini et al., 2021
NGE	Pergamino	2015	Campo	Parcela	4B	RAC875_c94519_419	22,08	3,33	BP11	0,08	0,14	4,9	Pretini et al., 2021
NGE	Pergamino	2015	Campo	Parcela	4B	RAC875_c94519_419	31,6	2,95	BP11	2,73	0,13	4,9	Pretini et al., 2021
NGE	Pergamino	2015	Campo	Parcela	4B	IAAV3848	32,67	2,67	BP11	0,01	0,08	576,1	Pretini et al., 2021
NGE	Marcos Juárez	2015	Campo	Parcela	4B	wsnp_Ex_c30695_39579408	37,33	3,46	BP11	0,03	0,12	20,59	Pretini et al., 2021
NGE	Marcos Juárez	2015	Campo	Parcela	4B	Tdurum_contig60051_169	124,35	4,6	B2002	0,11	0,13	644,7	Pretini et al., 2021
NGE	Marcos Juárez	2015	Campo	Parcela	4D	BS00036421_51	1,01	6,6	B2002	3,42	0,25	32,35	Pretini et al., 2021
CG	Pergamino	2015	Campo	Parcela	4D	BS00103682_51	5,81	4,55	BP11	0	0,13	455,25	Pretini et al., 2021
CG	Pergamino	2015	Campo	Parcela	5A	Excalibur_c11992_168	0,01	3,65	BP11	3,11	0,12	11,07	Pretini et al., 2021
PG	Pergamino	2013	Campo	Parcela	5A	Excalibur_c11992_168	0,01	2,69	BP11	0,09	0,08	11,07	Pretini et al., 2021
PG	Pergamino	2013	Campo	Parcela	5A	wsnp_Ex_c30551_39457494	52,14	4,52	BP11	3,31	0,12	480,29	Pretini et al., 2021
PG	Pergamino	2015	Campo	Parcela	5A	wsnp_Ex_c24215_33462239	57,1	9,44	B2002	0,16	0,31	526,62	Pretini et al., 2021
PG	Pergamino	2015	Campo	Parcela	5A	wsnp_Ex_c24215_33462239	57,1	3,25	BP11	0,11	0,1	526,62	Pretini et al., 2021
PG	Pergamino	2015	Campo	Parcela	5A	wsnp_Ex_c24215_33462239	57,1	2,85	BP11	3,26	0,1	526,62	Pretini et al., 2021
PG	Pergamino	2015	Campo	Parcela	5A	BobWhite_rep_c63943_76	62,49	5,17	BP11	3,44	0,18	547,42	Pretini et al., 2021
PG	Pergamino	2015	Campo	Parcela	5A	BS00029412_51	62,49	3,51	BP11	2,2	0,12	548,61	Pretini et al., 2021
PG	Marcos Juárez	2015	Campo	Parcela	5A	Tdurum_contig67291_367	78,09	5,59	BP11	3,03	0,2	573,84	Pretini et al., 2021
PG	Marcos Juárez	2015	Campo	Parcela	5A	wsnp_Ex_c26968_36188964	109,71	3,25	B2002	0,06	0,14	680,21	Pretini et al., 2021
PG	Marcos Juárez	2015	Campo	Parcela	5A	wsnp_Ku_rep_c72362_72059764	115,08	2,76	B2002	0,02	0,1	695	Pretini et al., 2021
PG	Marcos Juárez	2015	Campo	Parcela	5B	wsnp_Ku_c35090_44349517	9,25	5,68	BP11	0,09	0,18	34,3	Pretini et al., 2021
R	Pergamino	2012	Campo	Parcela	5B	BS00060015_51	11,25	7,65	BP11	0,11	0,25	41,3	Pretini et al., 2021
R	Pergamino	2012	Campo	Parcela	5B	Kukri_rep_c71114_838	12,87	3,93	BP11	0,14	0,13	70,3	Pretini et al., 2021
R	Pergamino	2012	Campo	Parcela	5B	Ex_c68034_498	14,97	6,06	BP11	0,16	0,21	21,5	Pretini et al., 2021
R	Pergamino	2012	Campo	Parcela	5B	IACX5818	17,1	2,54	BP11	2,15	0,05	442,38	Pretini et al., 2021
R	Pergamino	2013	Campo	Parcela	5B	Tdurum_contig58669_273	47,31	2,63	BP11	0,11	0,12	562	Pretini et al., 2021
R	Pergamino	2013	Campo	Parcela	5B	RFL_Contig5461_683	48,73	8,67	B2002	0,88	0,32	580,37	Pretini et al., 2021
R	Pergamino	2013	Campo	Parcela	5B	RFL_Contig5461_683	48,73	5,99	B2002	0,73	0,18	580,4	Pretini et al., 2021
R	Pergamino	2013	Campo	Parcela	5B	Kukri_c3973_101	64,33	3,81	BP11	2,84	0,09	601,3	Pretini et al., 2021
R	Pergamino	2013	Campo	Parcela	5B	BobWhite_c11038_605	72,33	3,15	BP11	0,04	0,15	654,8	Pretini et al., 2021
R	Pergamino	2015	Campo	Parcela	5B	BS00064947_51	76,55	2,61	BP11	0,08	0,07	688,7	Pretini et al., 2021
R	Pergamino	2015	Campo	Parcela	5B	BobWhite_c21482_192	76,55	4,25	BP11	0,07	0,18	631,03	Pretini et al., 2021
R	Pergamino	2015	Campo	Parcela	5D	wsnp_RFL_Contig2606_2264492	0,01	3,55	B2002	0,51	0,11	29,17	Pretini et al., 2021
R	Pergamino	2015	Campo	Parcela	5D	RAC875_rep_c78046_324	17,79	2,6	B2002	1,52	0,08	393,46	Pretini et al., 2021
R	Marcos Juárez	2015	Campo	Parcela	5D	wsnp_Ex_c22984_32207214	53,9	2,83	BP11	0,41	0,06	450,66	Pretini et al., 2021
R	Marcos Juárez	2015	Campo	Parcela	5D	BS00064691_51	66,03	2,58	BP11	2,44	0,07	496,07	Pretini et al., 2021
PSEa	Pergamino	2012	Campo	Parcela	6A	Tdurum_contig100733_89	33,66	4,91	B2002	0,01	0,19	22,03	Pretini et al., 2021
PSEa	Pergamino	2012	Campo	Parcela	6A	CAP12_c2701_221	102,19	8,07	BP11	4,63	0,22	559,5	Pretini et al., 2021
PSEa	Pergamino	2012	Campo	Parcela	6A	BS00040165_51	103,59	6,98	BP11	4,49	0,21	572,6	Pretini et al., 2021
PSEa	Pergamino	2013	Campo	Parcela	6A	BS00040165_51	103,59	7,54	BP11	0,76	0,19	572,6	Pretini et al., 2021
PSEa	Pergamino	2013	Campo	Parcela	6A	BS00040165_51	103,59	5,47	BP11	0,62	0,13	572,6	Pretini et al., 2021
PSEa	Pergamino	2013	Campo	Parcela	6A	Excalibur_c52196_235	122,27	2,52	BP11	1,61	0,09	595,48	Pretini et al., 2021
PSEa	Pergamino	2015	Campo	Parcela	6A	Excalibur_c52196_235	125,61	4,85	B2002	3,21	0,12	595,48	Pretini et al., 2021
PSEa	Pergamino	2015	Campo	Parcela	6A	wsnp_BF483091A_Ta_2_5	131,22	4,07	B2002	0,13	0,19	602,45	Pretini et al., 2021
PSEa	Pergamino	2015	Campo	Parcela	6B	GENE-4256_67	0,01	3,13	B2002	0,43	0,07	3,39	Pretini et al., 2021
PSEa	Pergamino	2015	Campo	Parcela	6B	wsnp_Ra_c33358_42248399	45,51	3,07	BP11	1,54	0,1	258	Pretini et al., 2021
LE	Pergamino	2012	Campo	Parcela	6D	BS00074495_51	16,77	4,25	BP11	3,03	0,35	6,9	Pretini et al., 2021
LE	Pergamino	2012	Campo	Parcela	6D	BS00074495_51	18,77	2,68	BP11	0,01	0,23	6,9	Pretini et al., 2021
LE	Pergamino	2012	Campo	Parcela	7A	Kukri_c12461_2357	9,79	2,92	BP11	0,11	0,09	35,6	Pretini et al., 2021
LE	Pergamino	2013	Campo	Parcela	7A	Kukri_c12461_2357	11,79	2,52	BP11	0,11	0,08	35,6	Pretini et al., 2021
LE	Pergamino	2013	Campo	Parcela	7A	Tdurum_contig16244_105	36,14	6,57	B2002	3,66	0,17	68,9	Pretini et al., 2021
LE	Pergamino	2013	Campo	Parcela	7A	Tdurum_contig16244_105	36,14	4,89	B2002	0,62	0,1	68,9	Pretini et al., 2021
LE	Pergamino	2015	Campo	Parcela	7A	Tdurum_contig82510_556	37,53	3,22	B2002	0,04	0,11	77	Pretini et al., 2021
LE	Pergamino	2015	Campo	Parcela	7A	Tdurum_contig82510_556	37,53	2,95	B2002	0,03	0,1	76,98	Pretini et al., 2021
LE	Pergamino	2015	Campo	Parcela	7A	wsnp_Ra_rep_c69620_67130107	45,08	2,92	B2002	2,25	0,09	85,61	Pretini et al., 2021
LE	Pergamino	2015	Campo	Parcela	7A	wsnp_Ra_rep_c69620_67130107	45,08	4,08	B2002	0,58	0,11	85,61	Pretini et al., 2021
LE	Pergamino	2015	Campo	Parcela	7A	wsnp_Ra_rep_c69620_67130107	46,08	3,41	B2002	4,25	0,14	85,61	Pretini et al., 2021
ET	Pergamino	2012	Campo	Parcela	7A	wsnp_Ex_rep_c70700_69597262	70,53	5,13	B2002	0,68	0,17	628	Pretini et al., 2021
ET	Pergamino	2012	Campo	Parcela	7A	Tdurum_contig93328_869	126,53	4,92	B2002	0,04	0,37	719,58	Pretini et al., 2021
ET	Pergamino	2012	Campo	Parcela	7A	wsnp_Ku_c16022_24798741	143,21	3,02	B2002	0,47	0,06	725,93	Pretini et al., 2021
ET	Pergamino	2012	Campo	Parcela	7A	Tdurum_contig14983_299	145,38	2,8	B2002	0,06	0,08	733,67	Pretini et al., 2021
ET	Pergamino	2012	Campo	Parcela	7B	RFL_Contig6075_618	0,01	2,9	BP11	1,67	0,1	0,6	Pretini et al., 2021
ET	Pergamino	2013	Campo	Parcela	7B	RFL_Contig801_2124	14,75	2,77	BP11	0,6	0,1	3,8	Pretini et al., 2021
ET	Pergamino	2013	Campo	Parcela	7B	Kukri_c109962_396	35,75	4,37	B2002	0,18	0,16	24,1	Pretini et al., 2021
ET	Pergamino	2013	Campo	Parcela	7B	BS00111144_51	39,22	2,81	BP11	0,1	0,09	33,8	Pretini et al., 2021
ET	Pergamino	2013	Campo	Parcela	7B	BS00035630_51	41,31	4,62	BP11	1,95	0,15	47	Pretini et al., 2021
ET	Pergamino	2015	Campo	Parcela	7B	wsnp_BF202806B_Ta_2_1	81,75	6,72	B2002	0,03	0,27	700,4	Pretini et al., 2021
ET	Pergamino	2015	Campo	Parcela	7D	Kukri_c10396_1588	119,13	6,4	BP11	0,09	0,21	611,23	Pretini et al., 2021
ET	Pergamino	2015	Campo	Parcela	7D	Kukri_c10396_1588	119,13	7,9	BP11	0,11	0,27	611,23	Pretini et al., 2021
ET	Pergamino	2015	Campo	Parcela	7D	Kukri_c10396_1588	119,13	7,13	BP11	0,02	0,24	611,23	Pretini et al., 2021

(1) Padre donador del alelo que incrementa los valores fenotípicos observados, BP11 = Baguette Premium 11 y B2002 = BIOINTA 2002. (2) El efecto aditivo se expresa en unidades del carácter medido.

Referencias

González, F. G., Terrile, I. I., & Falcón, M. O. (2011). Spike Fertility and Duration of Stem Elongation as Promising Traits to Improve Potential Grain Number (and Yield): Variation in Modern Argentinean Wheats. Crop Science, 51(4), 1693–1702. https://doi.org/10.2135/cropsci2010.08.0447
Pretini, N., Vanzetti, L. S., Terrile, I. I., Donaire, G., & González, F. G. (2021). Mapping QTL for spike fertility and related traits in two doubled haploid wheat (Triticum aestivum L.) populations. BMC Plant Biology, 21(1). https://doi.org/10.1186/s12870-021-03061-y
Terrile, I. I., Miralles, D. J., & González, F. G. (2017). Fruiting efficiency in wheat (Triticum aestivum L): Trait response to different growing conditions and its relation to spike dry weight at anthesis and grain weight at harvest. Field Crops Research, 201, 86–96. https://doi.org/10.1016/j.fcr.2016.09.026

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Baguette 19 x BIOINTA 2002

Ivan Muñoz — Tue, 22 Jun 2021 20:40:28 +0000

MAPEO GENÉTICO

Baguette 19 x BIOINTA 2002

Información de los Padres:

Baguette 19: Pedigrí cerrado y liberada como variedad por la empresa Nidera en Argentina en el año 2006.

BIOINTA 2002: (BPON / CCTP- F7-7792–122 (87)) fue desarrollado por CIMMYT y liberada como variedad en 2006 en Argentina por INTA.

Tipo de Población: Dobles Haploides (DH).

Tamaño de la Población: 102 genotipos.

Origen: EEA INTA Pergamino. Grupo de trabajo de la Dra. Fernanda González.

Plataforma de genotipado: 90K SNPs iSelect Infinium Array.

Figura descriptiva de la población, tomada de Pretini et al., (2020)

Caracteres fenotipados en la población hasta el momento y sobre los cuales se realizó la búsqueda de QTL y genes candidatos

Estructura de espiga

LE = Largo de Espiga (mm).

NEsp = Número de Espiguillas por Espiga (número).

DenEsp = Densidad de espiga (largo de espiga en mm/número de espiguillas).

CH = Chaff (Peso seco de la espiga sin granos a cosecha en mg).

GLPA = Gluma + Lema + Palea + aristas (mg).

R = Raquis (mg).

PSEa = Peso seco de espiga en antesis (mg).

Fertilidad de espiga y componentes de rendimiento

EFF = Eficiencia de Flores Fértiles (número de flores/gr PSEa).

FE = Fertilidad de Espiga (granos/gr PSEa).

FEm = Fertilidad de Espiga a madurez (granos/ gr CH).

FF = Flores Fértiles por Espiga (número).

FFEF = Flores Fértiles por Espiguillas Fértiles (número de flores/espiguillas fértiles).

FFET: Flores Fértiles por Espiguillas Totales (número de flores/ espiguillas totales).

EF: Espiguillas Fértiles por Espiga (número).

NGE: Número de Granos por Espiga (número).

CG: Cuajado de Granos (número de granos/flores).

PG: Peso Grano (mg).

Resultados del mapeo de QTL en la población Baguette 19 x BIOINTA 2002

Carácter	Localidad	Año	Ambiente	Unidad Exp.	Cromosoma	Marcador Pico	Posición (cM)	LOD	Donor (1)	Efecto aditivo (2)	R²	RefSeq v1.0 (pb)	Referencia
FF	Pergamino	2012	Campo	Parcela	1A	wsnp_Ex_c24686_33941368	0,01	4,39	B19	3,84	0,16	66,9	Pretini et al., 2021
LE	Pergamino	2015	Campo	Parcela	1A	RAC875_c54245_88	73,79	4,86	B2002	3,67	0,14	15,4	Pretini et al., 2021
EFF	Pergamino	2013	Campo	Parcela	1A	RAC875_c54245_88	74,4	4,36	B19	18,6	0,21	15,4	Pretini et al., 2020
EFF	Pergamino	2015	Campo	Parcela	1A	RAC875_c54245_88	74,4	5	B19	21,9	0,19	15,4	Pretini et al., 2020
FEm	Pergamino	2015	Campo	Parcela	1A	RAC875_c54245_88	74,4	4,2	B19	14,2	0,19	14,4	Pretini et al., 2020
CH	Pergamino	2015	Campo	Parcela	1A	RAC875_c54245_88	74,45	4,72	B2002	0,06	0,18	15,4	Pretini et al., 2021
FFEF	Pergamino	2013	Campo	Parcela	1A	RAC875_c54245_88	74,45	3,14	B19	0,11	0,14	15,4	Pretini et al., 2021
PSEa	Pergamino	2016	Invernáculo verano	Maceta	1A	wsnp_Ex_c4310_7770452	146,36	2,52	B2002	0,02	0,07	464,3	Pretini et al., 2021
CH	Marcos Juárez	2015	Campo	Parcela	1A	RAC875_c53185_802	148,36	5,21	B2002	0,04	0,21	480,5	Pretini et al., 2021
GLPA	Pergamino	2012	Campo	Parcela	1A	RAC875_c53185_802	148,36	5,84	B2002	0,03	0,21	480,5	Pretini et al., 2021
GLPA	Marcos Juárez	2015	Campo	Parcela	1A	RAC875_c53185_802	148,36	5,7	B2002	0,03	0,22	480,5	Pretini et al., 2021
FEm	Marcos Juárez	2015	Campo	Parcela	1A	RAC875_c53185_802	149,3	4,57	B19	9,9	0,11	480,5	Pretini et al., 2020
FF	Pergamino	2015	Campo	Parcela	1A	RAC875_c53185_802	155,35	3,52	B2002	2,7	0,18	480,5	Pretini et al., 2021
CH	Pergamino	2012	Campo	Parcela	1A	BS00023126_51	157,35	5,15	B2002	0,04	0,22	480,6	Pretini et al., 2021
FFEF	Pergamino	2015	Campo	Parcela	1B	Excalibur_c43567_850	21,18	2,6	B19	0,14	0,14	8	Pretini et al., 2021
LE	Pergamino	2016	Invernáculo verano	Maceta	1B	Excalibur_rep_c110246_86	24,04	3,23	B19	2,53	0,11	532,2	Pretini et al., 2021
CH	Pergamino	2015	Campo	Parcela	1B	IAAV8952	38,96	2,58	B2002	0,03	0,09	49,9	Pretini et al., 2021
GLPA	Pergamino	2015	Campo	Parcela	1B	IAAV8952	38,96	2,84	B2002	0,03	0,11	49,9	Pretini et al., 2021
PG	Pergamino	2013	Campo	Parcela	1B	RAC875_c32687_153	46,36	4,51	B2002	2,87	0,2	555,8	Pretini et al., 2021
FFET	Pergamino	2013	Campo	Parcela	1B	RAC875_c46093_492	53,55	2,77	B2002	0,12	0,13	633,3	Pretini et al., 2021
FE	Pergamino	2013	Campo	Parcela	1B	Ra_c21994_996	62,5	3,24	B19	17,8	0,12	656,8	Pretini et al., 2020
GLPA	Marcos Juárez	2015	Campo	Parcela	1B	Excalibur_c250_2008	63,53	3,25	B2002	0,02	0,11	657,4	Pretini et al., 2021
LE	Pergamino	2012	Campo	Parcela	1B	Excalibur_c250_2008	63,53	3,17	B2002	3,42	0,1	657,4	Pretini et al., 2021
NEsp	Pergamino	2013	Campo	Parcela	1D	D_GDS7LZN02GSCOW_131	1,76	3,98	B2002	0,55	0,16	433,3	Pretini et al., 2021
DenEsp	Pergamino	2016	Invernáculo verano	Maceta	1D	CAP7_c9557_164	3,2	3,88	B19	0,22	0,16	423	Pretini et al., 2021
EF	Pergamino	2013	Campo	Parcela	1D	Kukri_c18350_208	17,5	3,35	B2002	0,41	0,12	206,1	Pretini et al., 2021
FE	Pergamino	2016	Invernáculo verano	Maceta	1D	Excalibur_c15692_532	36,7	2,82	B19	22,5	0,1	12,1	Pretini et al., 2020
CG	Pergamino	2015	Campo	Parcela	1D	wsnp_Ku_c13229_21141117	40,5	4,95	B19	0,09	0,19	7,9	Pretini et al., 2021
GLPA	Pergamino	2015	Campo	Parcela	1D	BS00063255_51	124,49	3,38	B19	0,05	0,29	485,4	Pretini et al., 2021
CH	Pergamino	2015	Campo	Parcela	1D	BS00063255_51	127,49	5,47	B19	0,07	0,36	485,4	Pretini et al., 2021
NGE	Pergamino	2015	Campo	Parcela	1D	BS00063255_51	133,96	3,89	B19	3,06	0,15	485,4	Pretini et al., 2021
R	Pergamino	2016	Invernáculo verano	Maceta	2A	Kukri_c17467_2711	0,01	2,54	B19	0	0,05	4,7	Pretini et al., 2021
CH	Pergamino	2016	Invernáculo verano	Maceta	2A	Kukri_c35248_185	1,15	3,36	B19	0,02	0,09	43,4	Pretini et al., 2021
NGE	Marcos Juárez	2015	Campo	Parcela	2A	wsnp_Ex_c21409_30544027	54,18	5,1	B2002	3,36	0,18	683	Pretini et al., 2021
R	Pergamino	2015	Campo	Parcela	2A	BS00029332_51	59,88	3,4	B19	0,01	0,08	705,8	Pretini et al., 2021
DenEsp	Pergamino	2012	Campo	Parcela	2A	BobWhite_c17113_240	81,12	3,06	B2002	0,13	0,11	751,6	Pretini et al., 2021
NGE	Pergamino	2016	Invernáculo verano	Maceta	2A	Excalibur_c35919_107	83,67	2,66	B2002	1,84	0,1	754,5	Pretini et al., 2021
LE	Pergamino	2013	Campo	Parcela	2A	IAAV880	85,61	5,06	B2002	4,1	0,05	755,8	Pretini et al., 2021
DenEsp	Pergamino	2016	Invernáculo verano	Maceta	2A	wsnp_Ex_c2137_4014287	86,56	4,88	B2002	0,2	0,15	755,9	Pretini et al., 2021
EFF	Pergamino	2012	Campo	Parcela	2A	BS00065434_51	106,2	4,55	B19	9,6	0,14	774,1	Pretini et al., 2020
EF	Pergamino	2012	Campo	Parcela	2B	wsnp_Ra_c10712_17572884	22,74	2,78	B2002	0,55	0,11	18,4	Pretini et al., 2021
PG	Pergamino	2016	Invernáculo verano	Maceta	2B	BS00041323_51	55,05	3,94	B19	2,13	0,12	180,5	Pretini et al., 2021
CH	Pergamino	2015	Campo	Parcela	2B	wsnp_Ex_rep_c104478_89183627	57,08	2,82	B2002	0,04	0,1	447,8	Pretini et al., 2021
LE	Pergamino	2013	Campo	Parcela	2B	Tdurum_contig11172_443	58,08	2,79	B2002	2,29	0,1	476,6	Pretini et al., 2021
GLPA	Pergamino	2015	Campo	Parcela	2B	wsnp_Ex_c128_254788	59,11	2,53	B2002	0,03	0,1	529,1	Pretini et al., 2021
NEsp	Pergamino	2013	Campo	Parcela	2B	RAC875_c44407_364	61,1	3,12	B2002	0,46	0,12	615,9	Pretini et al., 2021
CH	Marcos Juárez	2015	Campo	Parcela	2B	Tdurum_contig12879_1200	64,15	3,71	B2002	0,03	0,14	712,6	Pretini et al., 2021
EF	Pergamino	2015	Campo	Parcela	2B	Tdurum_contig12879_1200	64,15	3,28	B2002	0,43	0,11	712,6	Pretini et al., 2021
FF	Pergamino	2015	Campo	Parcela	2B	Tdurum_contig12879_1200	64,15	7,85	B2002	3,81	0,31	712,6	Pretini et al., 2021
GLPA	Marcos Juárez	2015	Campo	Parcela	2B	Tdurum_contig12879_1200	64,15	3,73	B2002	0,03	0,13	712,6	Pretini et al., 2021
EF	Pergamino	2013	Campo	Parcela	2B	RAC875_c81984_707	64,64	4,57	B2002	0,51	0,17	719,8	Pretini et al., 2021
PG	Pergamino	2015	Campo	Parcela	2B	RAC875_c81984_707	64,64	2,62	B19	1,49	0,1	719,8	Pretini et al., 2021
FF	Pergamino	2013	Campo	Parcela	2B	Kukri_rep_c68903_301	65,14	7,15	B2002	3,32	0,33	730,2	Pretini et al., 2021
PSEa	Pergamino	2013	Campo	Parcela	2B	Kukri_rep_c68903_301	65,14	3,37	B2002	0,02	0,15	730,2	Pretini et al., 2021
GLPA	Pergamino	2013	Campo	Parcela	2D	Tdurum_contig49928_424	1,01	2,78	B19	0,01	0,11	11,8	Pretini et al., 2021
LE	Pergamino	2015	Campo	Parcela	2D	Kukri_c47664_191	7,28	2,54	B2002	2,05	0,06	17,2	Pretini et al., 2021
FE	Pergamino	2015	Campo	Parcela	2D	BS00079440_51	82,3	6,01	B19	31	0,21	79,4	Pretini et al., 2020
FEm	Pergamino	2015	Campo	Parcela	2D	BS00079440_51	82,3	3,74	B19	13,1	0,25	79,4	Pretini et al., 2020
CG	Pergamino	2013	Campo	Parcela	2D	BS00079440_51	83,32	3,6	B19	0,07	0,15	79,4	Pretini et al., 2021
FFET	Pergamino	2013	Campo	Parcela	2D	RAC875_c24364_307	167,32	2,72	B19	0,09	0,12	637,7	Pretini et al., 2021
DenEsp	Pergamino	2016	Invernáculo verano	Maceta	3A	Excalibur_c34889_526	0,01	2,66	B19	0,16	0,09	1,9	Pretini et al., 2021
NEsp	Pergamino	2016	Invernáculo verano	Maceta	3A	RAC875_c77648_367	3,42	5,99	B2002	0,99	0,16	12,2	Pretini et al., 2021
EF	Pergamino	2015	Campo	Parcela	3A	Excalibur_c62042_175	5,4	3,28	B2002	0,41	0,12	14	Pretini et al., 2021
EF	Pergamino	2013	Campo	Parcela	3A	Kukri_rep_c75764_60	8,14	2,83	B2002	0,36	0,1	20,1	Pretini et al., 2021
NEsp	Pergamino	2012	Campo	Parcela	3A	Kukri_rep_c75764_60	8,14	5,02	B2002	0,76	0,21	20,1	Pretini et al., 2021
EF	Pergamino	2012	Campo	Parcela	3A	BS00049032_51	10,59	5,37	B2002	0,78	0,23	25,9	Pretini et al., 2021
DenEsp	Pergamino	2016	Invernáculo verano	Maceta	3A	IAAV5729	25,58	2,6	B19	0,16	0,09	36,9	Pretini et al., 2021
CG	Pergamino	2015	Campo	Parcela	3A	RAC875_c31572_251	47,41	4,07	B19	0,08	0,16	650	Pretini et al., 2021
FFET	Pergamino	2013	Campo	Parcela	3A	Excalibur_c17655_467	48,53	2,7	B19	0,09	0,12	659,5	Pretini et al., 2021
PG	Pergamino	2016	Invernáculo verano	Maceta	3A	Excalibur_c17655_467	48,53	5,07	B2002	2,31	0,16	659,5	Pretini et al., 2021
GLPA	Pergamino	2012	Campo	Parcela	3A	Kukri_c18420_705	51,18	3,13	B2002	0,02	0,09	663,2	Pretini et al., 2021
PG	Marcos Juárez	2015	Campo	Parcela	3A	Kukri_c18420_705	51,18	3,99	B2002	1,22	0,11	663,2	Pretini et al., 2021
FEm	Pergamino	2013	Campo	Parcela	3A	wsnp_CAP11_rep_c4226_1995152	51,6	3,63	B19	13,2	0,11	685,1	Pretini et al., 2020
FEm	Marcos Juárez	2015	Campo	Parcela	3A	wsnp_CAP11_rep_c4226_1995152	51,6	4,39	B19	10,1	0,14	685,1	Pretini et al., 2020
FEm	Pergamino	2016	Invernáculo verano	Maceta	3A	wsnp_CAP11_rep_c4226_1995152	51,6	3,69	B19	13,6	0,09	685,1	Pretini et al., 2020
R	Pergamino	2013	Campo	Parcela	3A	BS00091887_51	62,23	3,42	B2002	0	0,12	695,7	Pretini et al., 2021
R	Pergamino	2016	Invernáculo verano	Maceta	3A	IAAV1134	68,97	3,25	B2002	0	0,08	700,7	Pretini et al., 2021
CH	Pergamino	2016	Invernáculo verano	Maceta	3A	Tdurum_contig15928_135	73,95	3,5	B2002	0,03	0,1	573,9	Pretini et al., 2021
GLPA	Pergamino	2016	Invernáculo verano	Maceta	3A	Tdurum_contig15928_135	74,95	3,98	B2002	0,02	0,11	709,1	Pretini et al., 2021
CH	Pergamino	2013	Campo	Parcela	3A	GENE-1833_70	77,33	2,77	B2002	0,01	0,1	712,1	Pretini et al., 2021
EF	Pergamino	2016	Invernáculo verano	Maceta	3B	Excalibur_c24391_321	31,82	3,39	B19	0,61	0,17	31,1	Pretini et al., 2021
LE	Pergamino	2012	Campo	Parcela	3B	wsnp_CAP7_c5097_2266314	88,7	4,55	B19	3,98	0,08	766,6	Pretini et al., 2021
PSEa	Pergamino	2016	Invernáculo verano	Maceta	3B	BS00039874_51	88,7	3,6	B19	0,02	0,1	673	Pretini et al., 2021
CG	Pergamino	2015	Campo	Parcela	3B	BobWhite_c11000_806	118,28	3,06	B2002	0,06	0,13	819,9	Pretini et al., 2021
EF	Pergamino	2015	Campo	Parcela	4A	Kukri_c63460_739	53,56	2,58	B2002	0,34	0,07	585,7	Pretini et al., 2021
FF	Pergamino	2016	Invernáculo verano	Maceta	4B	BobWhite_c46938_314	11,55	2,94	B2002	1,49	0,12	4,5	Pretini et al., 2021
FFET	Pergamino	2016	Invernáculo verano	Maceta	4B	BS00060041_51	11,99	3,75	B2002	0,12	0,15	7	Pretini et al., 2021
CG	Pergamino	2015	Campo	Parcela	4B	wsnp_Ex_c13357_21054802	15,1	2,54	B19	0,06	0,09	11,3	Pretini et al., 2021
PSEa	Pergamino	2016	Invernáculo verano	Maceta	4B	wsnp_Ex_c13357_21054802	16,1	2,83	B2002	0,02	0,07	11,3	Pretini et al., 2021
FF	Pergamino	2013	Campo	Parcela	4B	wsnp_Ex_c10347_16946522	17,19	2,94	B19	1,86	0,11	12,9	Pretini et al., 2021
LE	Pergamino	2016	Invernáculo verano	Maceta	4B	Kukri_c34633_69	26,64	6,53	B2002	3,84	0,23	21,4	Pretini et al., 2021
FFEF	Pergamino	2016	Invernáculo verano	Maceta	4B	Tdurum_contig50861_106	45,42	4,98	B2002	0,13	0,23	644,8	Pretini et al., 2021
R	Pergamino	2016	Invernáculo verano	Maceta	4B	IACX7540	57,29	4,07	B2002	0	0,11	660,5	Pretini et al., 2021
PSEa	Pergamino	2016	Invernáculo verano	Maceta	4B	Tdurum_contig81113_401	58,83	2,97	B2002	0,02	0,08	660,7	Pretini et al., 2021
R	Pergamino	2013	Campo	Parcela	4D	IAAV1674	0,01	5,67	B2002	0	0,18	1,9	Pretini et al., 2021
PSEa	Pergamino	2012	Campo	Parcela	4D	BS00099053_51	2,01	4,1	B2002	0,04	0,19	0,6	Pretini et al., 2021
R	Pergamino	2012	Campo	Parcela	4D	BS00099053_51	2,01	2,9	B2002	0,01	0,11	3,6	Pretini et al., 2021
NGE	Pergamino	2016	Invernáculo verano	Maceta	4D	BS00099053_51	2,93	3,24	B19	2,02	0,12	3,6	Pretini et al., 2021
FE	Pergamino	2016	Invernáculo verano	Maceta	4D	Kukri_rep_c68594_530	24,2	2,65	B19	21,5	0,09	12,7	Pretini et al., 2020
NGE	Marcos Juárez	2015	Campo	Parcela	4D	wsnp_Ex_rep_c107564_91144523	34,8	5,71	B19	3,29	0,22	26,5	Pretini et al., 2021
PSEa	Pergamino	2015	Campo	Parcela	5A	Tdurum_contig42421_526	0,01	3,36	B19	0,03	0	0,7	Pretini et al., 2021
EF	Pergamino	2015	Campo	Parcela	5A	BS00003643_51	6,55	3,14	B19	0,43	0,12	5	Pretini et al., 2021
PG	Pergamino	2016	Invernáculo verano	Maceta	5A	wsnp_Ku_c5071_9049540	40,17	2,82	B2002	1,58	0,07	430,2	Pretini et al., 2021
CG	Pergamino	2016	Invernáculo verano	Maceta	5A	Excalibur_c7180_862	40,67	3,59	B19	0,07	0,16	438,5	Pretini et al., 2021
LE	Pergamino	2016	Invernáculo verano	Maceta	5A	BS00022003_51	41,16	2,84	B2002	2,23	0,08	444,8	Pretini et al., 2021
EFF	Pergamino	2012	Campo	Parcela	5A	BS00083507_51	42,1	3,98	B19	8,4	0,11	461,5	Pretini et al., 2020
EFF	Pergamino	2013	Campo	Parcela	5A	BS00083507_51	42,1	5,05	B19	11,1	0,12	461,5	Pretini et al., 2020
EFF	Pergamino	2015	Campo	Parcela	5A	BS00083507_51	42,1	3,54	B19	19,2	0,23	461,5	Pretini et al., 2020
FE	Pergamino	2015	Campo	Parcela	5A	BS00083507_51	42,1	4,09	B19	22,4	0,11	461,5	Pretini et al., 2020
FE	Pergamino	2016	Invernáculo verano	Maceta	5A	BS00083507_51	42,1	2,91	B19	29,4	0,17	461,5	Pretini et al., 2020
FEm	Pergamino	2015	Campo	Parcela	5A	BS00083507_51	42,1	3,04	B19	9,4	0,13	461,5	Pretini et al., 2020
FEm	Pergamino	2016	Invernáculo verano	Maceta	5A	BS00083507_51	42,1	2,5	B19	22,1	0,23	461,5	Pretini et al., 2020
NGE	Pergamino	2013	Campo	Parcela	5A	BS00083507_51	42,15	4,56	B19	1,85	0,15	461,5	Pretini et al., 2021
NGE	Pergamino	2016	Invernáculo verano	Maceta	5A	BS00083507_51	42,15	3,89	B19	2,25	0,15	461,5	Pretini et al., 2021
PSEa	Pergamino	2015	Campo	Parcela	5A	BS00083507_51	42,15	4,3	B2002	0,04	0,2	461,5	Pretini et al., 2021
LE	Pergamino	2013	Campo	Parcela	5A	wsnp_Ex_c19647_28632894	44,15	3,67	B2002	2,43	0,12	470	Pretini et al., 2021
DenEsp	Pergamino	2015	Campo	Parcela	5A	Kukri_rep_c72046_78	48,77	5,48	B2002	0,13	0,2	512,2	Pretini et al., 2021
LE	Pergamino	2015	Campo	Parcela	5A	Kukri_rep_c72046_78	48,77	7,99	B2002	4,02	0,24	512,2	Pretini et al., 2021
LE	Pergamino	2012	Campo	Parcela	5A	BS00022818_51	49,26	4,5	B2002	3,91	0,15	524,2	Pretini et al., 2021
R	Pergamino	2012	Campo	Parcela	5A	BS00022818_51	49,26	3,11	B2002	0,01	0,13	524,2	Pretini et al., 2021
FFET	Pergamino	2012	Campo	Parcela	5A	wsnp_CAP11_c1740_947838	51,25	4,17	B19	0,1	0,17	536,7	Pretini et al., 2021
FF	Pergamino	2012	Campo	Parcela	5A	RAC875_rep_c107228_92	70,51	3,8	B19	3,08	0,14	567,7	Pretini et al., 2021
FFEF	Pergamino	2012	Campo	Parcela	5A	RAC875_rep_c107228_92	70,51	2,71	B19	0,11	0,11	567,7	Pretini et al., 2021
FFET	Pergamino	2015	Campo	Parcela	5A	RAC875_rep_c107228_92	70,51	3,12	B19	0,13	0,14	567,7	Pretini et al., 2021
CH	Pergamino	2016	Invernáculo verano	Maceta	5A	Excalibur_c3743_1624	72,99	6,37	B2002	0,04	0,18	583	Pretini et al., 2021
DenEsp	Pergamino	2016	Invernáculo verano	Maceta	5A	Vrn-A1:wsnp_Ku_c6977_12078791	73,49	2,81	B19	0,17	0,11	592,3	Pretini et al., 2021
GLPA	Pergamino	2016	Invernáculo verano	Maceta	5A	Vrn-A1:wsnp_Ku_c6977_12078791	73,49	5,27	B2002	0,03	0,19	592,3	Pretini et al., 2021
R	Pergamino	2016	Invernáculo verano	Maceta	5A	Vrn-A1:wsnp_Ku_c6977_12078791	73,49	7,1	B2002	0,01	0,2	592,3	Pretini et al., 2021
NEsp	Pergamino	2016	Invernáculo verano	Maceta	5A	wsnp_Ex_c8424_14192191	73,99	6,84	B2002	1,17	0,22	595,1	Pretini et al., 2021
PSEa	Pergamino	2016	Invernáculo verano	Maceta	5A	wsnp_Ex_c8424_14192191	73,99	4,82	B2002	0,02	0,14	595,1	Pretini et al., 2021
EFF	Pergamino	2016	Invernáculo verano	Maceta	5A	Vrn-A1	75,3	7,18	B19	24,3	0,13	587,4	Pretini et al., 2020
PG	Pergamino	2015	Campo	Parcela	5A	BS00032146_51	79,77	3,36	B19	1,53	0,13	615,2	Pretini et al., 2021
FF	Pergamino	2013	Campo	Parcela	5A	wsnp_Ra_c34269_43004949	104,5	3,17	B19	1,84	0,12	693,6	Pretini et al., 2021
NEsp	Pergamino	2015	Campo	Parcela	5A	RAC875_c48885_142	113,11	2,92	B19	0,39	0,09	706,5	Pretini et al., 2021
FFET	Pergamino	2015	Campo	Parcela	5B	wsnp_Ex_c33932_42333941	6,21	2,68	B2002	0,08	0,11	12,8	Pretini et al., 2021
NEsp	Pergamino	2013	Campo	Parcela	5B	CAP8_c909_312	19,7	2,98	B19	0,46	0,12	26,5	Pretini et al., 2021
CH	Pergamino	2016	Invernáculo verano	Maceta	5B	Tdurum_contig12540_72	27,34	2,53	B19	0,02	0,06	369,9	Pretini et al., 2021
PSEa	Pergamino	2013	Campo	Parcela	5B	wsnp_Ku_c14332_22613741	28,34	2,67	B19	0,02	0,11	401	Pretini et al., 2021
GLPA	Pergamino	2016	Invernáculo verano	Maceta	5B	wsnp_Ku_c14332_22613741	28,36	3,43	B19	0,02	0,11	401	Pretini et al., 2021
EF	Pergamino	2016	Invernáculo verano	Maceta	5B	wsnp_Ex_c54206_57165374	38,83	2,9	B2002	0,48	0,11	483	Pretini et al., 2021
NGE	Pergamino	2015	Campo	Parcela	5B	Ku_c11336_499	54,81	4,11	B2002	3,08	0,16	539,1	Pretini et al., 2021
FFET	Pergamino	2012	Campo	Parcela	5B	wsnp_Ku_c40334_48581010	56,85	3,21	B2002	0,13	0,14	546,8	Pretini et al., 2021
DenEsp	Pergamino	2016	Invernáculo verano	Maceta	5B	Tdurum_contig53072_1935	61,69	2,77	B2002	0,17	0,11	556,6	Pretini et al., 2021
PSEa	Pergamino	2016	Invernáculo verano	Maceta	5B	Tdurum_contig53072_1935	62,69	6,26	B19	0,03	0,2	556,6	Pretini et al., 2021
NEsp	Pergamino	2016	Invernáculo verano	Maceta	5B	Excalibur_c29304_176	63,75	7,01	B19	1,03	0,19	570,9	Pretini et al., 2021
EFF	Pergamino	2016	Invernáculo verano	Maceta	5B	Vrn-B1	64	8,23	B2002	31	0,21	573,8	Pretini et al., 2020
R	Pergamino	2015	Campo	Parcela	5B	Vrn-B1:Excalibur_c5329_1335	65,28	6,73	B2002	0,01	0,22	580,7	Pretini et al., 2021
EF	Pergamino	2013	Campo	Parcela	5B	Vrn-B1:Excalibur_c5329_1335	65,3	4,17	B2002	0,47	0,14	580,7	Pretini et al., 2021
CH	Pergamino	2016	Invernáculo verano	Maceta	5B	Tdurum_contig13773_321	69,36	9,09	B19	0,04	0,29	595,7	Pretini et al., 2021
GLPA	Pergamino	2016	Invernáculo verano	Maceta	5B	Tdurum_contig13773_321	69,36	6,51	B19	0,04	0,24	595,7	Pretini et al., 2021
R	Pergamino	2016	Invernáculo verano	Maceta	5B	Tdurum_contig13773_321	70,36	7,08	B19	0,01	0,2	595,7	Pretini et al., 2021
PG	Marcos Juárez	2015	Campo	Parcela	5B	wsnp_Ex_c32488_4113438	77,9	4,45	B2002	1,37	0,12	638,7	Pretini et al., 2021
PSEa	Pergamino	2013	Campo	Parcela	5B	IACX751	92,87	3,7	B2002	0,02	0,16	681,1	Pretini et al., 2021
EF	Pergamino	2016	Invernáculo verano	Maceta	5D	Kukri_c45387_380	2,33	2,55	B2002	0,45	0,09	549,6	Pretini et al., 2021
NEsp	Pergamino	2016	Invernáculo verano	Maceta	5D	Kukri_c45387_380	2,33	4,93	B2002	0,83	0,13	549,6	Pretini et al., 2021
EF	Pergamino	2016	Invernáculo verano	Maceta	5D	RAC875_c16419_585	4,36	2,69	B2002	0,46	0,1	556,6	Pretini et al., 2021
CG	Pergamino	2013	Campo	Parcela	5D	tplb0031c19_721	9,71	4	B2002	0,08	0,16	560,3	Pretini et al., 2021
GLPA	Pergamino	2012	Campo	Parcela	6A	BobWhite_c3714_659	1,8	2,8	B2002	0,02	0,07	8	Pretini et al., 2021
NEsp	Pergamino	2012	Campo	Parcela	6A	BobWhite_c3714_659	1,8	6,46	B2002	0,84	0,28	8	Pretini et al., 2021
R	Pergamino	2012	Campo	Parcela	6A	BobWhite_c3714_659	1,8	2,66	B2002	0,01	0,11	8	Pretini et al., 2021
DenEsp	Pergamino	2012	Campo	Parcela	6A	Excalibur_c12700_707	13,5	3,21	B19	0,14	0,11	15,8	Pretini et al., 2021
DenEsp	Pergamino	2013	Campo	Parcela	6A	Excalibur_c12700_707	13,5	3,02	B19	0,16	0,15	15,8	Pretini et al., 2021
DenEsp	Pergamino	2015	Campo	Parcela	6A	BS00070169_51	29,6	5,58	B2002	0,11	0,14	53,5	Pretini et al., 2021
PG	Pergamino	2013	Campo	Parcela	6A	wsnp_JD_rep_c65080_41454656	32,23	3,42	B2002	1,83	0,15	61,4	Pretini et al., 2021
DenEsp	Pergamino	2013	Campo	Parcela	6A	wsnp_JD_rep_c65080_41454656	32,3	2,78	B2002	0,12	0,14	61,4	Pretini et al., 2021
R	Pergamino	2015	Campo	Parcela	6A	Ku_c69999_111	36,2	3,26	B2002	0,01	0,1	552,5	Pretini et al., 2021
FEm	Pergamino	2013	Campo	Parcela	6A	BS00082191_51	44,3	2,69	B19	17	0,18	7,6	Pretini et al., 2020
FE	Pergamino	2013	Campo	Parcela	6B	BS00063109_51	40,3	4,38	B19	12,9	0,07	57,8	Pretini et al., 2020
PG	Marcos Juárez	2015	Campo	Parcela	6B	Kukri_rep_c117390_70	43,4	7,13	B2002	1,7	0,22	127,6	Pretini et al., 2021
PG	Pergamino	2013	Campo	Parcela	6B	Kukri_c38398_164	45,5	5,15	B2002	1,57	0,14	135,1	Pretini et al., 2021
R	Marcos Juárez	2015	Campo	Parcela	6B	BobWhite_c11503_296	53,57	6,29	B2002	0,01	0,25	662,1	Pretini et al., 2021
R	Pergamino	2015	Campo	Parcela	6B	wsnp_Ex_c18632_27501724	58,75	3,15	B2002	0,01	0,09	680,5	Pretini et al., 2021
EF	Pergamino	2016	Invernáculo verano	Maceta	6B	BS00027770_51	64,86	2,56	B2002	0,45	0,09	691	Pretini et al., 2021
EFF	Pergamino	2015	Campo	Parcela	6B	Ex_c17379_1431	66,6	2,82	B19	13,2	0,1	692,8	Pretini et al., 2020
DenEsp	Pergamino	2015	Campo	Parcela	6D	wsnp_Ra_c13881_21836489	11,24	2,78	B19	0,08	0,09	409,3	Pretini et al., 2021
DenEsp	Pergamino	2015	Campo	Parcela	6D	wsnp_Ra_c7200_12462543	77,47	2,98	B2002	0,13	0,15	58,8	Pretini et al., 2021
LE	Pergamino	2013	Campo	Parcela	6D	Ex_c7086_154	81,71	3,31	B2002	2,37	0,1	461,4	Pretini et al., 2021
R	Pergamino	2012	Campo	Parcela	6D	Ex_c7086_154	81,71	2,88	B2002	0,01	0,1	461,4	Pretini et al., 2021
DenEsp	Pergamino	2015	Campo	Parcela	7A	CAP11_c1473_320	33,32	4,25	B2002	0,16	0,16	52,4	Pretini et al., 2021
FFET	Pergamino	2015	Campo	Parcela	7A	IACX17522	34,8	2,53	B19	0,1	0,1	57,9	Pretini et al., 2021
GLPA	Pergamino	2012	Campo	Parcela	7A	IACX17522	34,8	3,73	B2002	0,02	0,11	57,9	Pretini et al., 2021
FEm	Marcos Juárez	2015	Campo	Parcela	7A	wsnp_Ku_rep_c113718_96236830	68,3	3,62	B19	7,1	0,07	625,7	Pretini et al., 2020
PG	Pergamino	2016	Invernáculo verano	Maceta	7A	Ra_c14761_1468	71,28	4,99	B19	4,89	0,14	670,8	Pretini et al., 2021
PG	Pergamino	2013	Campo	Parcela	7A	Ra_c14761_1468	71,9	3,22	B19	2,89	0,14	670,8	Pretini et al., 2021
FFET	Pergamino	2013	Campo	Parcela	7A	BS00047691_51	77,76	6	B19	0,19	0,31	118,3	Pretini et al., 2021
NEsp	Pergamino	2015	Campo	Parcela	7A	IAAV6957	90,51	5,96	B2002	0,62	0,2	675,2	Pretini et al., 2021
NEsp	Pergamino	2015	Campo	Parcela	7A	wsnp_CAP11_c298_250917	112,08	3,93	B19	0,5	0,12	724,1	Pretini et al., 2021
GLPA	Pergamino	2013	Campo	Parcela	7B	BS00062990_51	0,01	3,42	B2002	0,02	0,1	0	Pretini et al., 2021
CG	Pergamino	2013	Campo	Parcela	7B	Tdurum_contig11531_522	1,01	3,51	B2002	0,06	0,18	1	Pretini et al., 2021
CH	Pergamino	2013	Campo	Parcela	7B	Excalibur_c3489_182	1,01	2,83	B2002	0,02	0,11	1	Pretini et al., 2021
NGE	Pergamino	2013	Campo	Parcela	7B	Excalibur_c3489_182	1,83	6,11	B2002	2,27	0,21	1	Pretini et al., 2021
EF	Pergamino	2012	Campo	Parcela	7B	BobWhite_c20735_255	4,83	2,59	B2002	0,56	0,12	2,8	Pretini et al., 2021
CG	Pergamino	2015	Campo	Parcela	7B	Jagger_c3075_99	13,02	3,27	B2002	0,08	0,15	3,3	Pretini et al., 2021
FE	Pergamino	2015	Campo	Parcela	7B	RAC875_c27939_335	34,4	2,67	B2002	15,1	0,05	349,8	Pretini et al., 2020
R	Pergamino	2013	Campo	Parcela	7B	RAC875_c27939_335	34,43	5,22	B19	0	0,16	608,2	Pretini et al., 2021
FFEF	Pergamino	2015	Campo	Parcela	7B	Kukri_c100592_82	62,69	4,41	B19	0,1	0,16	648,1	Pretini et al., 2021
FFET	Pergamino	2016	Invernáculo verano	Maceta	7B	Kukri_c100592_82	62,69	4,33	B19	0,13	0,18	648,1	Pretini et al., 2021
FF	Pergamino	2015	Campo	Parcela	7B	Tdurum_contig47633_304	65,22	3	B19	2,07	0,1	659,7	Pretini et al., 2021
FF	Pergamino	2012	Campo	Parcela	7B	Tdurum_contig4658_106	71,7	4,56	B19	3,61	0,17	680,2	Pretini et al., 2021
FFEF	Pergamino	2012	Campo	Parcela	7B	RAC875_c60191_114	71,7	5,06	B19	0,15	0,22	697,1	Pretini et al., 2021
FFET	Pergamino	2012	Campo	Parcela	7B	Tdurum_contig4658_106	71,7	6,27	B19	0,17	0,21	680,2	Pretini et al., 2021
R	Pergamino	2013	Campo	Parcela	7B	Tdurum_contig4658_106	71,7	3,06	B2002	0	0,09	680,2	Pretini et al., 2021
R	Pergamino	2015	Campo	Parcela	7B	Tdurum_contig4658_106	71,7	4,15	B2002	0,01	0,13	680,2	Pretini et al., 2021
PG	Marcos Juárez	2015	Campo	Parcela	7D	RAC875_c1829_321	77,29	2,82	B2002	1,17	0,09	58,9	Pretini et al., 2021
NGE	Marcos Juárez	2015	Campo	Parcela	7D	wsnp_Ex_c11813_18968198	100,22	2,77	B2002	2,12	0,09	451,1	Pretini et al., 2021

(1) Padre donador del alelo que incrementa los valores fenotípicos observados, B19 = Baguette 19 y B2002 = BIOINTA 2002. (2) El efecto aditivo se expresa en unidades del carácter medido

Referencias

González, F. G., Terrile, I. I., & Falcón, M. O. (2011). Spike Fertility and Duration of Stem Elongation as Promising Traits to Improve Potential Grain Number (and Yield): Variation in Modern Argentinean Wheats. Crop Science, 51(4), 1693–1702. https://doi.org/10.2135/cropsci2010.08.0447
Pretini, N., Vanzetti, L. S., Terrile, I. I., Börner, A., Plieske, J., Ganal, M., Röder, M., & González, F. G. (2020). Identification and validation of QTL for spike fertile floret and fruiting efficiencies in hexaploid wheat (Triticum aestivum L.). Theoretical and Applied Genetics, 133(9), 2655–2671. https://doi.org/10.1007/s00122-020-03623-y
Pretini, N., Vanzetti, L. S., Terrile, I. I., Donaire, G., & González, F. G. (2021). Mapping QTL for spike fertility and related traits in two doubled haploid wheat (Triticum aestivum L.) populations. BMC Plant Biology, 21(1). https://doi.org/10.1186/s12870-021-03061-y
Terrile, I. I., Miralles, D. J., & González, F. G. (2017). Fruiting efficiency in wheat (Triticum aestivum L): Trait response to different growing conditions and its relation to spike dry weight at anthesis and grain weight at harvest. Field Crops Research, 201, 86–96. https://doi.org/10.1016/j.fcr.2016.09.026

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